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阴阳辨证在疾病辨证中占有重要地位。弄懂阴阳可以避免临床上诊断的错觉诊断。阴阳既能概括整个病情，又能用于一个症状的分析，最重要的是可以应用于疾病治疗。《素问•阴阳应象大论》中说“阳病治阴，阴病治阳”。张仲景将伤寒病分为阴证、阳证，以三阴、三阳为总纲。明代医家张景岳也强调：“凡诊脉施治，必先审阴阳，乃为医道之纲领。”
阴证和阳证
凡病在里、在血，属寒，正气不足，肌体反应多呈衰退的表现均属阴证的范畴。其症状为精神萎靡、面色苍白、畏寒肢冷、气短声低、口不渴、便溏、尿清、舌淡苔白、脉沉迟微弱等。其病因病机为年老体弱或内伤久病，或外邪内传脏腑等导致正气衰弱、阳虚阴盛。
凡病在表、在气，属实、属热，正气未伤，肌体反应多呈亢盛的表现均属阳证的范围。其症状为心情烦躁、面赤身热、气壮声高、口渴善冷饮、呼吸气粗、腰痛拒按、大便秘结、尿短赤、舌红绛苔黄、脉浮洪或滑数有力等。其病因病机为邪气入侵，邪盛而正气亦强，正邪激争所致。
养生的目的，是健身防病和延年益寿。阴阳学说主张顺应自然养生，做到春夏养阳，秋冬养阴，精神内守，饮食有节，起居有常，法于阴阳，以保持肌体内部以及肌体与外界环境之间的阴阳相协调平衡。人体的阴阳变化与自然界四时阴阳变化协调统一，就可以达到防病和延年益寿的目的。
亡阴和亡阳
亡阴和亡阳多是疾病发展过程中的危重证候。亡阴多在高热大汗、剧烈吐泻、失血过多等阴液迅速丧失的情况下出现，常见汗出而粘、呼吸短促、手足温、躁动不安、渴喜冷饮、面色潮红、舌红而干、脉数无力；亡阳常因邪毒炽盛，或内脏病变严重耗损体内阳气所致，亦能因大汗、大吐，大泻、大出血等所致，常见冷汗如珠、面色灰白、呼吸气微、畏寒肢冷、精神萎靡、舌淡苔润、脉细微欲绝。