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(1)胸腺：胸腺既是一个免疫器官，又是一个内分泌器官。刚刚出生的婴儿胸腺重量大约为10～15g；14～15岁时，胸腺结实而肥大，其重量约为25～35g；到青春期，胸腺开始萎缩，但仍然能保持胸腺素的分泌能力。到了45岁，胸腺明显萎缩，70岁时几乎完全为脂肪组织所取代。
胸腺是人体重要的中枢淋巴器官，是免疫细胞(T细胞)分化演变的场所。所以胸腺衰退必然会影响T细胞的生成及功能。胸腺分泌的胸腺素起着抗老防衰、恢复机能的作用。人到更年期，胸腺萎缩，分泌的胸腺素已微乎其微，机体细胞的免疫功能下降。中年以后，循环中的淋巴细胞数目逐渐减少，60岁时约为中年人的70%，其中主要是T细胞的减少。胸腺随着增龄而萎缩和退化，是机体免疫功能减低的重要原因之一。
(2)甲状腺：甲状腺位于气管的两侧，分泌甲状腺素。甲状腺素对机体的糖、脂肪、蛋白质的代谢过程和生长发育起着重要的调节作用。
更年期甲状腺在组织形态学及功能上都有一定改变。随着增龄，甲状腺有一定程度的萎缩及纤维化，重量有所减轻，滤泡直径减小，血管狭窄，结缔组织增多，多发性结节性甲状腺肿的发生率也增高，其中女性更为多见。虽然对甲状腺的研究颇多，但至今尚无一致意见。多数学者认为，甲状腺功能从20岁以后即开始随年龄增长而逐渐减退。从基础代谢率的情况看，每10年大约下降3%，进入更年期后更为加速。从20～80岁，基础代谢率可下降50%。随着增龄，甲状腺对碘的吸收率也相应降低，甲状腺激素的合成速度减慢。有人用放射性碘标记甲状腺素，经研究发现，20岁时甲状腺素平均转换率近于88μg，80岁时则减到42μg，平均减少50%。
因此，更年期出现甲状腺机能减退者并不少见。但是也有一部分人，尤其是妇女，在更年期由于雌激素的减少，继发地引起垂体前叶的功能代偿性增强，在促性腺激素过多分泌的同时，促甲状腺素也可分泌过多，从而引起甲状腺滤泡的肥大，功能亢进。因此，在更年期也可发现甲状腺功能亢进者。
(3)胰岛：胰岛是胰腺中的内分泌组织。其中β细胞分泌的胰岛素直接参与糖代谢。胰岛的功能下降大约起始于30岁，每增加10岁下降6%～18%。进入更年期后功能减弱更为明显，表现为对葡萄糖的耐受量减低。巴尔提摩(Baltimore)的老年医学调查研究中心指出：口服葡萄糖耐受量实验，2小时血糖值，从25岁起，每增加10岁，便增加6mg；给更年期的妇女过多的葡萄糖或胃肠道外补充高营养，可见血糖明显升高，尿糖出现。进入更年期，糖尿病的发病率显著增高，而且随年龄的增高而不断上升。有报道称60岁以上糖尿病的发病率是40岁以下的8倍，这可能与胰岛的β细胞活性减弱、胰岛素分泌的绝对减少和相对减少有关。