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(1)条件致病性感染 艾滋病始终伴有条件致病性感染，以混合性感染为多，且难以控制，成为90％患者的死亡原因。有关病原包括：原虫类（卡氏肺囊虫肺炎、鼠弓形体感染、隐孢子虫病、兰氏贾弟鞭毛虫感染及贝氏孢子球虫感染）；病毒类（巨细胞病毒感染、单纯疱疹病毒感染、水痘-带状疱疹病毒感染、J.C病毒引起的进行性多灶性脑白质病、EB病毒所致的原发性单核细胞增多症及其他病毒感染）；真菌类（白色念珠菌感染、隐球菌感染、组织胞浆菌病、毛霉菌病、曲霉菌病）；细菌类（非典型分支杆菌感染、奴卡氏菌感染、结核杆菌感染、绿脓杆菌感染、伤寒杆菌感染）；蠕虫类（类圆线虫感染）。
(2)卡波希肉瘤 25%～40％的病人并发这种肿瘤，一般经18～36个月死亡。