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1-8. 介导适应性免疫的抗原特异性细胞的克隆
固有免疫的防御系统对多数病原体是有效的，但是，这种固有免疫的防御系统是被动的，他依赖于种系编码的受体，这种受体能识别病原体，而病原体的进化要比他所感染的宿主快的多。这就可以解释了为什么固有免疫的防御系统仅仅识别负荷表面分子的病原体，因为这些表面分子在进化过程中是保守的，也是大多数病原体共有的。令人惊讶地是，很多致病菌（pathogenic bacteria）已经进化了一种保护性的荚膜（capsule），这种荚膜可使致病菌隐藏其负荷的表面分子以避免被识别和吞噬。病毒并不携带与细菌类似的表面分子，他们很少被巨噬细胞直接识别。然而，病毒和荚膜化的细菌仍能被DCs细胞以一种非受体依赖的过程--巨噬胞饮作用（macropinocytosis）吸收，显示他们感染特性的分子被暴露，DCs细胞被活化，并将抗原递呈给淋巴细胞。适应性免疫反应的淋巴细胞的识别机制就是克服固有免疫系统所面临的限制，使他能够识别各种各样的抗原，也就是能特异地识别各种各样的病原体。
进入血循环的每一个天然淋巴细胞只特异性地负荷一种单一的抗原受体，这些抗原受体的特异性是由一个唯一的遗传机制所决定的，这种机制始于淋巴细胞的发育过程并产生数以百万计的不同的基因亚型以编码这些受体分子。如此以来，一个淋巴细胞仅仅携带一种特异的受体，每种淋巴细胞的特异性是不同的。这样，体内数以百万计的淋巴细胞就携带了数以百万计的特异的抗原受体，这就是每一个个体的淋巴细胞受体库（lymphocyte receptor repertoire）。在生命过程中，这些淋巴细胞还要经历一个自然选择的过程，只有经过自然选择过程的淋巴细胞才能在遇到抗原时与其受体结合，被激活，增殖和分化为效应细胞。
克隆选择学说是Macfarlane Burnet于20世纪50年代提出的，具体见图Figure A-1.15. 克隆选择。Macfarlane Burnet的克隆选择学的大意是：This selective mechanismto explain why antibodies, which can be induced in response to virtually any antigen, are produced in each individual only to those antigens to which he or she is exposed. He postulated the preexistence in the body of many different potential antibody-producing cells, each having the ability to make antibody of a different specificity and displaying on its surface a membrane-bound version of the antibody that served as a receptor for antigen. On binding antigen, the cell is activated to divide and produce many identical progeny, known as a clone; these cells can now secrete clonotypic antibodies with a specificity identical to that of the surface receptor that first triggered activation and clonal expansion。