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2009年12月14-15日，我司与科技部基础研究司联合召开973计划中医基础理论研究专项2009年度交流会议。全国人大常委会原副委员长周光召、中国协和医科大学强伯勤院士、同济大学校长裴刚院士、卫生部原副部长佘靖等出席。卫生部副部长、国家中医药管理局局长王国强到会并做重要讲话。
全国人大常委会原副委员长周光召院士在会议开幕式上说：“现在是中医药发展、中医药科研所处的最好时机。”卫生部副部长、国家中医药管理局局长王国强强调，加强中医基础研究具有十分重要的战略意义和现实意义，中医理论基础研究面临良好机遇。王国强指出，当前中医理论基础研究还面临着研究难度大、重视不够、相关领域竞争激烈等挑战和困难，尚需长期而又艰苦的努力。他建议：实施中医理论专项，一是要瞄准国家重大战略需求，搞好顶层设计，选准突破口，着力解决一批制约中医药创新发展的重大理论问题和关键科学问题；二是尊重中医理论特点和规律，探索完善中医理论基础研究的新方法、新技术和新模式，凸显中医的特色与优势；三是进一步加强管理和服务，吸纳相关学科最新研究成果，推动多学科合作；四是更好发挥专家组的宏观指导和学术咨询的作用，做好战略规划和顶层设计；五是更大范围推动学术交流，加强不同学科和优势团队的协作交流，及时总结推广阶段性成果，使专项真正取得实效，真正为中医药学术和事业的发展产生动力，提升贡献率。
973计划中医理论基础研究专项设立5年来，投入经费近3亿元，支持了17个项目，研究力量主要投放在四方面：中医基础理论研究（5个项目）、中药基础理论研究（6个项目）、针灸理论基础研究（5个项目）、评价理论基础研究（1个项目）。参研人员2165人，171家参研单位中中医药行业外的占到67％。