NVIDIA®(英伟达™)2010年GPU技术大会(GTC 2010)将于9月20日星期一至9月23日星期四期间在美国加利福尼亚州圣何塞市的圣何塞会议中心举行。 在去年首届大会成功模式的基础上,GTC 2010将包含更广泛、更深入的精选技术研讨会、互动式专题报告、技术预览以及业内与
学术界的诸多演示会。
此次GTC 2010大会NVIDIA邀请了包括国内外媒体、研究人员、生物领域领域专家和全球知名软硬件合作厂商参加,意在让更多地人意识到GPU对整个世界说产生的变化。
计算生物学正在进入一个激动人心的全新领域:能够模拟活细胞的结构和过程。 让我们来了解一下“计算显微镜”吧,这是一款全新的研究仪器,科学家能够使用它以近乎无限的分辨率来模拟生物分子。 计算显微镜对最先进的物理显微镜来说是一个补充,可以对当今生物医学研究起到指导作用。
在这场主题演讲中,计算生物学界先驱、伊利诺伊大学厄本那香槟分校的Klaus Schulten博士将介绍计算显微镜、展示这方面所广泛使用的软件、重点介绍借助计算显微镜所取得的重大发现,其中包括查看蛋白质折叠、破译细胞中的基因代码以及提取光合作用中的太阳能等等。 他还展望了未来的情景:细胞X线断层摄影术与计算技术将能够呈现出整个生命形式的原子排列视图。
通过NVIDIA GPU进行高性能运算能轻松模拟出蛋白质的流动规律,而这种应用在以前是不可能实现的。通过这种模拟我们能够发现其实病毒也是有规律的。
GPU在数学、化学、物理方面的研究
除了模拟蛋白质流动等,GPU还能实现在物理、化学和数学等方面的应用。
模拟两个不同原子之间的碰撞力度。
前面提到的应用中,在不采用GPU进行计算时需要1.5小时,而采用GPU计算则只需要三分钟,这足足提升了25倍之多。
在进行DNA模拟时,左边采用CPU进行计算模拟只能到一个很粗糙的程度,而采用GPU计算进行模拟的,则可以达到一个非常精细的程度。
采用一个CPU进行转换的时间是一小时10分钟,而我们采用3个GPU进行计算时只需要90秒的时间。
最后Klaus Schulten博士提到GPU为生命科学领域达到了三个目的:一是更精准的计算;二是计算的速度更加高效;三是达到了以前没有无法达到的效果。
作者:
2010-9-26