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《上海交通大学学报（医学版）》 (原上海第二医科大学学报)为医药卫生类综合性学术期刊，本刊以全面反映本校在科研、医疗、教学和管理等领域中所取得的新成果、新理论、新技术、新经验，引导科技发展，培养学术人才，增进学术交流为办刊宗旨。本刊面向国内外公开发行，被包括中国自然科学类核心期刊、中国科技论文统计源期刊、美国《化学文摘（CA）》、俄罗斯《文摘杂志（AJ）》等国内外权威检索系统收录。近年来，期刊刊载论文的基金论文比达50%以上，期刊影响因子大幅提高，得到了出版行政管理部门、评估专家、作者、读者及订阅单位的充分肯定和广泛关注。
为了进一步扩大《上海交通大学学报（医学版）》的影响，同时也为了方便读者、作者、审稿专家对稿件的操作，2009年10月，本刊做出了进一步的调整：依托网络平台，推出网刊（http://xuebao.shsmu.edu.cn），试用期刊信息管理系统，实现管理现代化、规范化、科学化。网刊包括：远程投稿系统、远程审稿系统、采编管理系统、网刊管理系统、读者订阅系统、网站内容管理系统。作者、审稿专家只需要注册成为系统的一个用户，用自己的用户名和密码登录系统后，可在任何地点、任何时间在线完成远程投稿、远程审稿等一系列工作，还可通过此平台向编辑部发送消息。而读者订阅管理系统使浏览文章更方便，网刊平台为读者提供了多种查询检索模式，方便读者检索文章。
通过《上海交通大学学报（医学版）》网刊的推广，科技期刊信息管理系统的采用，我们相信这一举措将大大方便读者阅读本刊，更加方便作者投稿以及专家审稿，实现了编辑部编辑出版、管理工作的数字化。提升期刊的整体管理水平、学术水平和出版水平，为构建和谐社会、建设创新型国家发挥积极的作用。