深圳地区艾滋病患者HIV-1毒株膜蛋白V3环的氨基酸变异分析

2006年01月19日 中华传染病杂志 2005 Vol.23 No.5 P.301-304 17 （深圳）为了了解深圳地区艾滋病患者体内不同HIV-1亚型膜蛋白V3环的氨基酸序列特征及变异特点。研究者采用逆转录套式聚合酶链反应(RT-nested-PCR)对艾滋病患者血浆HIV RNA进行扩增，对扩增产物直接测序并进行序列对比、翻译和分析。结果深圳地区艾滋病患者感染HIV病毒分属B与CRF01-AE亚型，病毒V3顶端的四肽特征主要为:GPGQ 48%、GPGR 36%、其他形式16%；其中AE亚型GPGQ百分比为76.9%，B亚型GPGR百分比为75%；还发现DQDR、DQGQ等少见V3环顶端四肽组成形式。V3环发生与SI表型有关的氨基酸突变形式高达80%。可见深圳地区艾滋病患者感染病毒V3环顶端四肽主要为GPGQ与GPGR，V3环序列高度变异，出现一些少见的V3环顶端四肽组成形式值得进一步研究。