肠道菌用结构识别控制淀粉分解

多形类杆菌是人体肠道菌群中的主要成员之一，它是一类典型的多糖采集菌。多形类杆菌18%的基因组针对多糖的分解和利用。左图左上角代表这种微生物的淀粉利用系统（SUS），它是由糖苷酶，多糖蛋白的识别，以及运输蛋白构成的；右下角是Koropatkin等学者描述的SusD结构，它通过识别淀粉的螺旋结构与多糖结合。

  

人体的肠道中微生物可以执行一些不用基因组编码的功能，包括分解不能消化的膳食多聚糖。根据肠道菌群的处理能力，经过糖分解细菌的基因组分析可以确定了一些特定的多聚糖，研究这些多聚糖的输入和分解有助于人们确定其相关蛋白质的结构。在7月9日的《结构》（Structure）杂志上，Koropatkin等人描述了多形类杆菌结合、分解淀粉所涉及的一个蛋白质（SusD）的结构。这种独特的α-螺旋蛋白质包含一个弧形的芳香残基，它可以补充淀粉的天然螺旋结构，从而使这种构象可以有效地与麦芽七糖结合。此外，它还能够以强于线性结构的亲和力与环状低聚糖结合。

  

几个SusD蛋白质-低聚糖的复合物表明，可能有一种内在的识别配体的弹性结构，这种结构是由低聚糖的三维空间构象决定的，而不与复合糖的相互作用有关。（科学网  武彦文/编译）