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来自上海交通大学Bio-X研究院，中科院上海生科院营养科学研究所等处的研究人员发表了题为“Dynamic Network of Transcription and Pathway Crosstalk to Reveal Molecular Mechanism of MGd-Treated Human Lung Cancer Cells”的文章，介绍了一种抗癌药物在肺癌治疗过程中的调控网络和分子机制，并解析了参与这一调控网络的转录因子和信号通路之间的相互沟通方式。相关成果公布在PLoS ONE杂志上。
文章的通讯作者是上海交通大学贺林院士，以及刑清河（Qinghe Xing，音译），贺林院士研究组主要从事人类遗传学和各类组学等方面的研究。这项研究得到973项目，863项目，国家自然科学基金等处的支持。
肺癌是严重危害我国人民生命健康的重大疾病之一，揭示关键的分子标记对于肺癌发生发展，以及临床上的诊断治疗具有重要意义。近期的研究揭示了几种不同的肺癌分子标记，但是对于这些标记遗传调控网络相关组织规律，科学家们还并不十分清楚。
在这篇文章中，研究人员采用网络分量分析（Network Component Analysis，NCA），以及通路串扰分析（Pathway Crosstalk Analysis，PCA），构建了人体肺癌系在施用一种抗肿瘤药物：莫特沙芬钆50uM剂量后，产生的调控网络，从中找到了一系列关键的转录因子。
莫特沙芬钆是一类广谱含金属离子的抗癌药物，在临床上可以单独使用，也可与化疗和放疗联用，研究显示，这一药物能抑制多种对癌细胞生存很重要的酶类，目前已有基于此类药物的新一代抗癌药物作为癌症定位载体，用于运载已知或潜在的化疗药物。
研究人员利用这一抗癌药物，找到了一组关键的转录因子，以及这些转录因子的靶基因，还有这些调控网络中涉及的信号途径。研究人员发现一些转录因子之间，转录因子和靶基因之间，还有一些信号途径之间可能存在相互作用，这些关联包括ESR1/Sp1，E2F1/Sp1，c-MYC-ESR，Smad3/c-Myc，和NFKB1/RELA（转录因子之间），BMP41/Est1, TSC2/Myc, APE1/Sp1/p53, RARA/HOXA1，和SP1/USF2（转录因子和靶基因之间），PPAR激素受体信号通路，脂肪细胞因子信号通路（信号途径之间）。
这些研究结果为肺癌调控网络，以及莫特沙芬钆街道的人类肺癌细胞治疗调控机制，提出的新观点。
在肺癌遗传学研究方面，近期来自上海生科院生化与细胞所等处的研究人员，在非吸烟肺腺癌患者中寻找到一个新的致病基因融合CCDC6-RET。在在线发表的三篇Nat Med 文章 (2012, epub Feb 12) 和一篇Genome Res文章 (2012, epub Jan 23)也报道了类似的工作，指出RET融合基因是肺癌中新的关键致病基因。
目前临床上已经有能够有效抑制RET激酶活性的抑制剂，因此这些研究将对于那些具有RET基因融合的肺腺癌患者的“个体化”治疗具有直接的指导意义。
（生物通：张迪）