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近日，国际知名演化生物学家李文雄院士在《自然通讯》（Nature Communications）上发表了题为“DNA replication timing and selection shape the landscape of nucleotide variation in cancer genomes”的研究论文，证实DNA复制时序和选择对形成癌症基因组中核苷酸变异图谱起重要作用。
李文雄院士是国际著名的遗传学家，曾获得多项学术荣誉，如美国艺术与科学院院士、美国国家科学院院士、中研院第22届院士等。2003年提出了“分子时钟”的研究方法，加速揭开了人类基因的秘密，因而荣获基因和演化领域的国际最高殊荣“巴仁奖（Baizan Prize）”，成为国际巴仁基金会成立以来第三位于该领域获奖者，更是华人第一人。
在各种疾病中，癌症可谓是“头号杀手”。世界卫生组织报告显示，2008年全世界约有1270万癌症新增患者，760万死于癌症，尤其在发展中国家，癌症新增例数达56%，据推测到2020年前，全球每年将新增1500万癌症患者。
所有的癌症都是由突变所引起，这些突变称为体细胞突变，是在人一生当中，由最初正常细胞中的DNA逐渐出现的。基因发生突变的体细胞，在与正常体细胞生存竞争的过程中不断进化，最终变成永生不死的癌细胞。癌细胞无限制地增殖，进而导致肿瘤的发生。在癌变发生的过程中，体细胞的每一次突变，都会在其基因组上留下印迹。就像是在一次次地加盖印戳。分析基因组上不同时期体细胞变异时留下的印迹，就可以得到癌细胞完整的进化史。
此外，癌细胞形成，就像所有自然选择（或Darwinian）过程一样，还受到环境选择力和细胞适应性策略的支配。仅通过遗传改变，而忽视适应性情况来研究癌症和它的增殖最有可能是徒劳的。在化疗的“自然压力”下，这种“适应性情况”中，抗性癌细胞群常常会发生进化。因此比较癌细胞和生物体的进化对阐明癌症的遗传基础具有重要意义。
在这篇文章中，研究人员分析了超过400个癌症基因组的体细胞突变，发现在S期体细胞单核苷酸变异随复制时间增高的频率相比于生殖细胞单核苷酸变异和体细胞大型结构改变包括扩增和缺失更加显著。在癌细胞中非同义与同义单核苷酸变异的比值要高于生殖细胞，表明对于体细胞突变净化选择较弱。在具有频发突变的基因中，只有癌症驱动基因显示出强阳性选择的迹象，尽管频发突变基因中迟复制区域富集，癌症驱动基因的迟复制区域却减少。这些结果表明复制时序在癌细胞单核苷酸变异图谱形成中发挥了显著的作用。
（生物通：何嫱）