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青海省卫生厅在青海省委、省政府的领导下，积极推进城镇医疗卫生体制改革和农村卫生改革，实施项目拉动、依法治医和科教兴医战略，以农村卫生、公共卫生、社区卫生和中藏医药为重点，大力加强卫生基础设施、公共卫生体系、农村三级卫生服务网络、城市医疗服务体系和卫生人才队伍建设，用有限的卫生资源和卫生投入基本解决了全省547万各族群众的基本卫生问题，各族群众健康水平大幅度提高。
近年来，卫生厅积极响应国家西部开发战略，大力促进青海省与全国其他省份及国际间的医疗技术服务交流与协作，为全省的卫生事业发展注入新的活力。