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檀香为檀香科植物檀香树干的心材。味辛，性温。归脾、胃、肺经。功能行气、散寒、止痛。主治胸腹胀痛，霍乱吐泻，噎膈吐食，寒疝腹痛及肿毒。
李东垣认为：“檀香能调气而清香，引芳香之物上行至极高之分，最宜橙橘之属，佐以姜枣，将以葛根、豆蔻、缩砂、益智，能行阳明之经，在胸膈之上，处咽嗌之中，同为理气之药。”黄绣宫认为：“白檀香气味辛温，熏之清爽可爱，凡因冷气上结，饮食不进，气逆上吐，抑郁不舒，服之能引胃气上升，且能散风避邪，消肿住痛。功专入脾与肺，不似沉香力主降而能引气下行也。”李时珍认为：“白檀香辛温，气分之药也。故能理卫气而调脾肺，利胸膈。紫檀咸寒血分之药也，故能和营气而消肿毒，治金疮。”
其应用配伍为：用于寒凝气滞之胃痛，胸痹，寒疝腹痛。檀香辛散温通，能宣发气机，擅理肺脾之气，利膈宽胸，故胸脘滞气尤宜，治胃脘冷痛，痞满不食，泛吐清水，可与橘皮、干姜、丁香等同用，以加强行气散寒止痛之功。如《杨氏家藏方》五辛宽膈汤。若血瘀气滞而致的胃痛或胸卒痛，须与丹参、砂仁配伍，以活血行气止痛，如《时方歌括》丹参饮。现代临床以本品与苏合香、青木香、乳香等为丸含服用于冠心病心绞痛，有较好的效果。本品散寒止痛，亦可用于寒疝腹痛，常与乌药、延胡索等配用。
檀香还可用于霍乱呕吐，噎膈饮食不入。因檀香有利膈之功，故又可用于气逆呕吐之证。治寒湿霍乱，吐泻腹痛，可与散寒行气止痛之高良姜、草豆蔻等合用，如《百一选方》冷香汤：若胃有停饮而致脘痞呕吐者，在温胃化饮药中配用本品，如《通俗伤寒论》香砂二陈汤：治噎膈饮食不入，可与茯苓 、橘红相配伍。
近人常用本品配丹参，主治气滞血瘀，络道不和，胸痹诸症；高血压病，冠心病之心绞痛等症。
阴虚火盛之人禁服。