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通常在整个HPLC系统中，使用.010"ID×1/16"OD的管子是很安全的。使用.010"ID的管子，一般使用的管长度下压降可忽略不计，而且，该内径连接管导致的谱带展宽可以忽略。Upchurch该规格PEEK管颜色为自然色或蓝色（1531和1531B）。
用1.8mmOD的管子取代一些药物系统中使用的含氟聚合物管子。Agilent1100系统在高压流路中使用新的1/32"OD的管子。PEEK管还有其它尺寸，一般长度为50′和100′。
一个主要的制药公司的独立研究报告显示将柱后通道由熔融石英管转换为PEEK管可以使LCMS的色谱性能得到明显改善。明显减少了峰拖尾，而且消除了因为进样量减少引起的峰不对称。
Teflon管的色谱应用：聚四氟乙烯对于标准液相色谱系统的所有低压部分都特别适用。