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小阴茎是一种较普通的先天性异常，阴茎长度比同龄人小2个标准差（cm），称为小阴茎。
近几年，小阴茎治疗方法有一定改进。但是，雄激素的替代仍然是主要的治疗方法。由于给患者体内提供了足够的睾酮，将刺激阴茎的发育，并不影响骨髂的生长和闭合。Aller推荐的治疗方法为每3周口服睾酮25mg，总量不超过100mg。应通过治疗前、后的阴茎长度测量（耻骨至龟头）评价治疗效果。应从一岁开始治疗。目的是使患儿生殖器官发育与身体增长保持一致。如患儿阴茎生长比较同龄儿童差，应重复上述治疗。对伴有睾丸下降不全的患儿，应在2岁前行睾丸下降固定术。亦可应用LHRH，促进阴茎的发育和睾丸下降。
【病因学】
病因：小阴茎与体内睾丸酮缺乏有关，睾丸酮缺乏是激素靶器官发育不良的结果。常伴有睾丸发育差，下降不全。另外一些器官发育（包括阴囊）也可受累。下丘脑分泌的黄体生成素释放激素（LHRH）减少。由于垂体——性腺轴未受影响，以睾丸酮治疗仍有一定效果，但是，其作用可能是微弱的。如局部应用5％睾丸酮乳膏将有助于阴茎增大，其作用是局部激素的吸收，尔后通过全身性促进生殖系统的发育。
【临床表现】
外生殖器尤其阴茎较小，可无阴囊，或不能摸到睾丸，前列腺亦特小。（付表一）
表1 从婴儿到成人阴茎疲软时的长度及睾丸大小
| 年龄（岁） | 阴茎长度（cm±SD） | 睾丸直径（cm±SD） |
| 0.2～2 | 2.7±0.5 | 1.4±0.4 |
| 2.1～4 | 3.3±0.4 | 1.2±0.4 |
| 4.1～6 | 3.9±0.9 | 1.5±0.6 |
| 6.1～8 | 4.2±0.8 | 1.8±0.3 |
| 8.1～10 | 4.9±1 | 2±0.5 |
| 10.1～12 | 5.2±1.3 | 2.7±0.7 |
| 12.1～14 | 6.2±2 | 3.4±0.8 |
| 14.1～16 | 8.6±2.4 | 4.1±1 |
| 16.1～18 | 9.9±1.7 | 5±0.5 |
| 18.1～20 | 11±1.1 | 5±0.3 |
| 20.1～25 | 12.4±1.6 | 5.2±0.6 |
小阴茎应与隐匿阴茎区别。应排除其他内分泌和中枢神经系统的异常。骨骼的延迟生长，嗅觉缺失，学习能力低下，促肾上腺皮质激素（ACTH）和促甲状腺激素（TSH）的缺乏，都与小阴茎有关。性功能的情况也应该详细询问。