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测序先锋Craig Venter完整测定自身基因组

来源:科学网
摘要:备受争议的基因组研究先锋CraigVenter又有新动作。他的研究小组详细地测定了他自己的基因组序列,使得人们能够观测单个基因组中基因的变化。CraigVenter研究所的SamuelLevy表示,此次的测序与之前的有所不同。之前的测序没有在每个染色体的两个副本之间、甚至是不同捐赠者的DNA之间作出区分,从而混淆了等位基因(allele......

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  备受争议的基因组研究先锋Craig  Venter又有新动作!他的研究小组详细地测定了他自己的基因组序列,使得人们能够观测单个基因组中基因的变化。初步分析报告发表在最新一期的《PLoS生物学》上。

  此次研究的领导者、美国J.  Craig  Venter研究所的Samuel  Levy表示,此次的测序与之前的有所不同。之前的测序没有在每个染色体的两个副本之间、甚至是不同捐赠者的DNA之间作出区分,从而混淆了等位基因(alleles)。

  在此次研究中,Levy和研究小组利用从Venter  DNA中提取的1900万条基因序列和另外的1300万条序列,使用最新的方法详细检测了不同版本的相同染色体的基因序列。最终他们发现了400万种变异,包括单个核苷差异、序列插入和删除以及单个基因副本数的不同。大约有44%的Venter基因在来自每个染色体的副本之间存在遗传差异。Levy  说,Venter的两组染色体存在0.5%的差异,这表明DNA变异可能比之前认为的要多出7倍多。

  在发表的论文中,研究人员重点突出了Venter基因组的一些特点。比如他的ABCC11基因序列表明,Venter耳朵可能产生潮湿的耳垢;在紧靠他的MAOA基因之前,有四条重复序列,而只具有三个重复序列被认为会增加反社会行为的倾向;另外,他的APOE序列和SORL1  gene基因均表明可能会增加患早老性痴呆病(Alzheimer)和心血管病的风险。

  美国加州联合基因组研究所(Joint  Genome  Institute)的主任Edward  Rubin表示,此次研究描绘了更加清晰的人类基因组图谱,它表明基因组并不是统计学意义上的,而应该是一种线性的排列。

  为了更好地阐述基因组怎样影响他的生活,Venter即将推出一本新书——《解码生命》(A  Life  Decoded)。美国冷泉港实验室Banbury中心的执行理事Jan  Witkowski将在10月4号的《自然》杂志上为这本书撰写书评。

  Venter表示,单个基因的改变并不能控制他的命运,大多数疾病都归因于人性因素和环境因素。Witkowski对此表示赞同,他同时认为阅读别人的基因组会给别人带来不自在的感觉,就像看别人的病历一样。(科学网  梅进/编译)
作者: 2007-9-5
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