并行蛋白质修饰鉴定软件登陆上海生科院

        2008年4月23日至25日，中国科学院计算机网络信息中心超级计算中心派蛋白质课题组的2名代表赴上海生科院，为中科院系统生物学重点实验室调试安装并协助测试了P_InsPecT软件，并就下一阶段的工作计划及目标与上海生科院吴家睿副院长交换了意见。

        InsPecT是一款开源的蛋白质翻译后修饰识别软件，因其能够盲搜索鉴定蛋白质发生的化学修饰与突变而备受瞩目，经过超算中心并行优化后的P_InsPecT软件，在获得必要的计算资源后，原来一周的计算时间被减少到一个小时，这大为缩短了蛋白质研究的周期与时间。经过了前期的周密准备，超算中心的蛋白质课题组人员利用一天的时间顺利地完成了软件移植与安装，并协助生科院方面开始测试小规模的质谱数据。由于并行效果较为可观，生科院方面希望能够建立从P_InsPecT到蛋白质鉴定分析系统SEQUEST的桥梁，尽快实现一个高效的蛋白质翻译后修饰识别平台。

        在与吴院长座谈的过程中，他详细询问了软件并行优化的技术细节，并对生科院方面应用此软件表现出了很高的热情与兴趣。他充分肯定了此次交流的价值，并强调长期的互访与相互学习是必须的，同时他也期望双方能够大踏步地迈向深入合作，期待超大规模计算技术能为蛋白质研究带来无限精彩。

        由中科院网络中心超级计算中心承担的“蛋白质鉴定与翻译后修饰识别的高性能计算研究”课题隶属于“院知识创新工程重大项目“面向蛋白质科学的高性能计算研究”，本课题立足交叉学科，意在通过高性能计算的支持，研发高效精确的蛋白质翻译后修饰识别算法与工具，并为广大的蛋白质科研人员提供服务。