华大基因启动“狮虎豹基因组计划”

        继2009年启动“三极动物计划”和顺利完成“国际大熊猫基因组计划”之后，深圳华大基因研究院11日披露，将启动“狮虎豹基因组计划”。该计划的近期目标是在1年内完成狮虎豹基因组的序列框架图，并在行为科学和保护生物学等众多学科领域探索基因组测序成果的应用。此次“狮虎豹基因组计划”是由深圳华大基因研究院、北京大学、黑龙江虎林园、中科院昆明动物所、美国圣・迭亚哥动物保护研究所（SanDiegoZoo’s  Institute  forConservationResearch）以及其他中外科学家共同发起并承担。



　　狮虎豹同为大型猫科动物，在生态系统金字塔中，作为顶级消费者，直接或间接地控制以植物为食的初级消费者的数量，对生态系统的稳定起着极为重要的作用。



　　虎被称为万兽之王，是体型最大的猫科动物，主要分布在亚洲。虎栖息于森林、草地、沼泽地带。它们是一种喜欢独行的肉食动物，具有领域性，一般每只虎有自己的领地，除了交配时期，从不和其他虎交往。它们以鹿、野猪、水牛等为食，体表的条纹为它们提供了很好的隐蔽条件。



　　狮子是可以与虎匹敌的大型猫科动物之一，除了力量超群和速度飞快之外，还是唯一一种雌雄两态和营群居生活的猫科动物。过去狮子曾广泛分布在欧洲东南部、中东、印度和非洲大陆，如今由于人类的捕杀和对其生存环境的侵占，其数量和种类已大大减少，野生狮的分布基本限于非洲的局部地区。



　　豹是自然环境适应性最强的猫科动物之一。豹的种类很多，有广泛分布在亚洲、非洲的金钱豹；有生活在东南亚的云豹；有活动在非洲沙漠草原地区的猎豹；还有在我国西南及相邻国家的雪豹等。豹的体能极强，视觉和嗅觉灵敏异常，性情机警，既会游泳，又善于爬树，是食性广泛、胆大凶猛的食肉类。



　　2010年是我们中国的虎年，在中国，虎是正义、勇猛、威严的象征。对虎文化的崇尚意识，已经成为中华民族共同的文化观念，中国人虎年测虎，对中国文化的发展和继承有着重要意义，还将推动全社会对虎等大型猫科动物的重视和保护。因此华大基因研究院将虎选为“狮虎豹基因组计划”的先行物种。



　　与虎的重要的保护意义相比，其基因组学研究却近乎空白。虎的基因组与人的基因组大小相似，约为3G。虎基因组信息将会对虎研究的众多领域产生深远的影响，为人们深入了解虎这一重要物种提供遗传学证据和生物学基础。首先，该计划为虎的人工繁殖、人工野化提供科学依据。另外，由于将开创性地探索基因组信息在众多学科领域的交叉应用，这一计划也会推动基因组测序技术的普及和发展。除此以外，基因组科学的成果能准确地测定虎的世代和亲缘关系，为人类定性和定量地认识环境与遗传因素的相互作用提供新的重要模式。



　　华大基因在2010年将陆续启动东北虎、华南虎、孟加拉虎、亚洲狮、非洲狮、云豹、雪豹等大型猫科动物基因组测序，完成这些基因组计划将对研究猫科动物的进化和比较基因组学带来新的研究思路。上述这些大型猫科动物测序都是华大基因研究院已启动的“千种动植物基因组计划”中的重要组成部分。



　　除了对上述猫科动物的比较基因组研究，老虎与狮子的杂交后代是非常理想的研究野生杂交的生物模型。在完成狮子和老虎的基因组序列解读之后，深圳华大基因计划启动虎狮兽（雄虎雌狮杂交后代）和狮虎兽（雄狮雌虎杂交后代）的基因组与表观基因组项目。在很多家养物种间，杂交是一种非常重要的获取杂种优势表型的方法，例如杂交水稻和马骡，这种杂交的手段对于人类农业社会的发展具有重要意义。相对的，野生物种的杂交要比家养物种困难得多。在野生环境中，不同物种间的杂交受精被认为是产生新物种的一种潜在可能途径。基于解读的狮虎兽和虎狮兽的基因组与表观基因组信息，这将是从DNA序列和染色质变化水平重新解释定义“杂种”和“物种”的机会。