小熊猫和大熊猫，只相差一个字，那么，它们是同一科的吗？老虎、美洲豹、金钱豹、雪豹、非洲狮这5个豹属动物中，谁最先分化出来、谁的辈分大呢？
中科院昆明动物研究所张亚平院士、云南大学于黎研究员和罗静研究员等采用了整合线粒体和核基因多基因序列以及基因组信息的研究策略，及国际上新近发展的针对多基因分析的系统发育树推断方法进行研究，对部分真兽类哺乳动物的进化史进行了重新定位，并填补了一些领域的研究空白。
揭开身世之谜
小熊猫不属于熊科和浣熊科
通过多年研究，研究人员获得了一系列原创性成果，并获得了2010年度云南省科学技术奖自然科学类一等奖。
项目课题组对食肉目犬型超科各科间的系统发育关系进行了系统地研究，揭示了鳍脚类、熊科、臭鼬、大熊猫和小熊猫的系统发育位置。这一部分工作中以小熊猫系统发育位置的解决最具代表性。
小熊猫，又叫红熊猫、红猫熊、小猫熊，有时也叫火狐，因其似熊非熊的形态特征，使得它的进化地位一直存在很大争议：形态学研究将小熊猫归于浣熊科，或将大、小熊猫并为熊猫科；线粒体基因组研究则认为小熊猫与臭鼬科或由浣熊科、鼬科和臭鼬科组成的进化枝关系最近。这个争议一直没有得到解决。
课题组通过研究，支持小熊猫是浣熊科和鼬科的“姐妹群”，与它们关系最近。小熊猫既不属于浣熊科，也不属于熊科，而应单独列为小熊猫科。
这项研究，揭开了小熊猫的身世之谜。
提出新假说
棕熊和北极熊可能是亲戚
虽然熊科只包括8个物种，但其系统发育关系重建非常困难且存在很大的争议。除了普遍支持大熊猫和眼镜熊是最早分化的熊科物种以外，关于在上新世早期才发生分化的其他6个熊科物种（棕熊、北极熊、懒熊、马来熊、亚洲黑熊和美洲黑熊）的进化位置一直没取得一致的看法。
研究人员首次从核基因的角度，并整合以前的线粒体基因对熊科系统发育关系进行了探讨。研究结果支持棕熊和北极熊的姐妹群关系以及亚洲黑熊和美洲黑熊之间较近的亲缘关系。
老虎是豹属5个物种中的前辈
猫科包含的37个物种都具有重要的保护生物学价值，而它们的分类归属以及系统发育关系一直倍受争议。有学者甚至将猫科中存在的问题与曾经困扰人类多年的关于黑猩猩、大猩猩及人的三歧式关系相比。
通过对猫科豹亚科物种的多个线粒体和核基因序列进行综合分析，结果提出了与以往基于单个或少量线粒体基因分析结果不同的系统发育假说，提出在豹属5个物种之间新的系统发育关系，即老虎最早分化，然后是美洲豹、 非洲狮，最后是金钱豹和雪豹。
理清兔子间关系
中国野兔分成两个进化枝
兔形目兔科兔属有30个物种，如草兔、云南兔、海南兔、东北兔、高原兔等，它们不仅具有一定的经济价值，而且在生态系统中占有重要地位，是研究生态系统的一种重要动物模型。
但是，因其快速扩散分化以及形态特征的极其相似，关于其分类、系统发育关系不清楚。
科研人员首次采用多个线粒体基因标记的比较分析，对分布于中国范围内的兔属物种进行基于DNA分子水平的分类和系统发育研究。
系统发育研究结果显示：中国野兔分成两个进化枝，一个包括高原兔和云南兔，另一个包括其他6个物种（华南兔、雪兔、草兔、东北黑兔、塔里木兔和东北兔），其中雪兔和草兔的关系更近。
疣猴亚科起源非洲
在上新世或更新世早期扩散到亚洲
疣猴亚科属于灵长目猴科，是经历快速辐射和近期物种形成事件的典型类群，对其分类和系统发育关系的研究具有很大的难度。
于黎等研究人员采用多个线粒体基因片段，第一次在分子水平上建立疣猴亚科的系统发育关系，并提出疣猴亚科起源于非洲，而后在上新世或更新世早期扩散至亚洲的观点。
系统发育研究结果表明：疣猴亚科分为非洲疣猴和亚洲疣猴，非洲疣猴最先发生分歧。亚洲疣猴中，长鼻猴属和金丝猴属关系最近，并与白臀叶猴属聚在一起。其他亚洲疣猴分为两个进化枝，一个包括长尾叶猴、黑乌叶猴和紫脸叶猴，另一个包括菲氏叶猴和黑叶猴。
作者：
2011-7-6