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Cell:庄小威研究组2013再发文章

来源:生物通
摘要:来自哈佛大学,霍德华休斯医学院的研究人员发表了题为“ISWIRemodelersSlideNucleosomeswithCoordinatedMulti-Base-PairEntryStepsandSingle-Base-PairExitSteps”的文章,利用单分子荧光共振能量转移技术,解析了一种重要的超家族酶如何协调重塑核小体,帮助完成核小体移位的。相关成果公布在Cell杂志上。领导这一研究的......

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来自哈佛大学,霍德华休斯医学院的研究人员发表了题为“ISWI Remodelers Slide Nucleosomes with Coordinated Multi-Base-Pair Entry Steps and Single-Base-Pair Exit Steps”的文章,利用单分子荧光共振能量转移技术,解析了一种重要的超家族酶如何协调重塑核小体,帮助完成核小体移位的。相关成果公布在Cell杂志上。 

领导这一研究的是著名的华裔女科学家,哈佛大学庄小威(Xiaowei Zhuang)教授,庄教授早年毕业于中国科技大学少年班,34岁的时候就成为了哈佛大学正教授,并入选了去年公布的84位新晋美国科学院院士名单,她的当选刷新了最年轻美国科学院华人院士的纪录,可谓是传奇式人物。

ISWI(imitation switch)属于ATP依赖的染色质重塑复合物SWI2/SNF2超家族,它区别于其他SWI2/SNF2相关亚家族的特点是ATP酶亚基ISWI含有SANT结构域及SLIDE结构域。大量研究表明,ISWI家族成员参与细胞核内包括基因表达调控、DNA复制及染色质重塑等众多生物学过程,但是其在核小体移位中的作用,至今还不是很清楚。

在这篇文章中,研究人员利用单分子荧光共振能量转移技术 (single molecule fuorescence resonance energy transfer, smFRET)分析了ISWI家族在核小体移位中的作用。

在单分子技术出现之前,分子生物学实验结果往往只代表测量时间内大量分子的平均行为,而生物体系一般是不均一的体系。因此监测单个分子的行为具有重要的意义。当单个荧光基团 (fuores-cence fuorophore) 标记到目标分子后,它能在多方面去探测目标分子。比如通过荧光成像技术可以了解目标分子在细胞内的空间分布。

当一个分子或两个相互作用的分子上标记两个不同的荧光基团后,一个是在能量转移过程中提供能量,即供体D(donor);另一个接受能量,即受体A(acceptor)。这样可以运用荧光共振能量转移 (fuorescence resonance energy transfer, FRET) 技术来对体系进行研究。因此,比单个荧光基团标记更具有优势,称为单分子荧光共振能量转移(single molecule fuorescence resonance energy transfer,smFRET) 技术。

smFRET近年来发展迅猛,在研究蛋白质折叠和构象变化、RNA折叠和催化、膜融合蛋白和肌动蛋白的运动,以及信号转导等方面相当有效。由于其能在单个分子内或分子复合物中,以纳米级别,实时追踪变化,因此可用于解答许多重要的生物学问题。

庄小威研究组采用smFRET方法获得了不少重要的研究成果,这项研究也采用了这种方法发现不同的ISWI家族成员能以相似的步骤模式,通过酶催化亚基完成核小体移位。这过程具体为:7 bp的DNA移位,然后是3 bp朝着核小体外侧移动。 

研究人员还发现在核小体入口侧上的DNA移动,只出现在7 bp的移位出口侧,而3 bp的每个入口侧步骤能令另外三个碱基移动到出侧。这些研究结果指出,这种重塑机制在不同核小体位点具有良好的协调性,从而完成这种多步骤的DNA移动过程。

今年庄小威研究组还在Science杂志上,详细介绍了smFRET技术如何设置,如何操作等步骤,指出可以利用这种技术来监控构象动态,为解析核小体重塑等生物分子进程提供实时的检测手段。

作者: 2013-3-18
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