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近日，中国科学院水生生物研究所关于鱼类低温适应机制研究的论文Transcriptomic characterization of cold acclimation in larval zebrafish在BMC genomics在线发表。该论文首次报道了斑马鱼早期幼体具备建立低温耐受的机制。
低温暴露不但影响鱼类的生长和发育，严重时还可导致鱼体死亡。鱼类的低温耐受能力受遗传、热历程和发育阶段等因素的影响。近年来，鱼类低温适应机制逐渐成为研究热点，然而鱼类发育的早期阶段是否具备低温适应能力，以及低温适应过程中的转录和转录后调控机制尚不清楚。
中科院水生所崔宗斌研究员课题组以斑马鱼为模型研究鱼类的低温适应机制。研究发现，斑马鱼受精后96h幼体低温（12℃）暴露前先在16℃处理24h可以显著降低死亡率，说明其具备在较低温度条件下形成低温耐受的能力。RNA-seq分析鉴定出1431个低温诱导基因和399个抑制基因。生物信息学分析结果表明，低温诱导表达的基因主要参与RNA剪接、核糖体生物发生、蛋白质分解代谢和RNA转运等生物学过程。由于RNA-seq具有全基因组范围内检测基因表达的技术优势，本研究还鉴定到大量受低温调控的可变剪接和可变启动子使用事件。该论文和本课题组前期研究（PLoS ONE, 2012, 7(5): e37209）结果为后续深入研究鱼类低温适应过程中的信号传导机制及关键基因功能提供了重要线索。
该研究工作得到国家自然科学基金资助，由龙勇助理研究员等人完成。