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水稻的株型是决定水稻产量的主要因素之一，水稻理想株型的塑造是提高水稻产量的重要途径。控制水稻理想株型的主基因IPA1 (Ideal Plant Architecture 1) 编码一个含SBP-box的转录因子，参与调控多个生长发育过程。
李家洋研究组最近的研究发现，IPA1作为转录激活因子起作用，通过全基因组染色质免疫共沉淀-测序分析分别确定了水稻茎尖和幼穗含有IPA1结合位点相关的一系列基因，证明IPA1蛋白可以通过SBP-box结构域直接与受调控基因的核心基序GTAC相结合，也可以通过与TCP家族的转录因子PCF1和PCF2相互作用与TGGGCC/T基序间接相结合。通过RNA测序对全基因组表达谱进一步分析显示IPA1参与调控多个生长发育过程。此外，该研究还表明，IPA1可以通过TB1调控水稻分蘖，通过DEP1调控水稻的株高和穗长。该研究为进一步解析水稻株型调控遗传调控网络奠定了基础。
该研究结果已在线发表于The Plant Cell (DOI:10.1105/tpc.113.113639)。李家洋研究组的路则府同学，余泓博士和熊国胜博士为论文的共同第一作者。
该研究项目得到“973”计划和国家科技重大专项的资助。