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绘制大黄鱼全基因组精细图谱

来源:中国科学报
摘要:国家海洋局第三海洋研究所联合浙江大学、深圳华大基因及中国海洋大学等单位,共同完成了大黄鱼全基因组测序,并绘制出大黄鱼基因组精细图谱。大黄鱼是目前我国海水网箱养殖单产量最高的鱼种,相关产业链年产值达100亿元。但近年来,大黄鱼种质退化、抗逆性差、病害频发等问题严重制约了该产业的持续健康发展。同时,大黄......

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国家海洋局第三海洋研究所联合浙江大学、深圳华大基因及中国海洋大学等单位,共同完成了大黄鱼全基因组测序,并绘制出大黄鱼基因组精细图谱。相关成果近日在线发表于《公共科学图书馆·遗传学》杂志。

大黄鱼是目前我国海水网箱养殖单产量最高的鱼种,相关产业链年产值达100亿元。但近年来,大黄鱼种质退化、抗逆性差、病害频发等问题严重制约了该产业的持续健康发展。同时,大黄鱼具有的一些特殊生理及行为特性,如对环境胁迫敏感,尤其是对低氧和空气暴露等极为敏感,使其可能成为研究环境胁迫应答机制的良好模型。

此次研究人员获得的大黄鱼基因组精细图谱,基因区覆盖率达到98%以上,包含25401个蛋白编码基因。结果显示,大黄鱼不仅具有发达的先天性免疫系统,还具有相对完整的获得性免疫系统。该研究进一步揭示了神经—内分泌—免疫/代谢新的调控网络在大黄鱼脑应答低氧胁迫中发挥的重要作用,并发现皮肤黏液蛋白在大黄鱼应对空气暴露胁迫中的多重保护功能。这为了解鱼类环境胁迫适应性的分子遗传机制提供了新认识,也为培育性状优良的大黄鱼抗逆品种提供了有价值的基因资源。

作者: 2015-4-14
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