美国弗若斯特沙利文公司最新发表的研究报告认为，随着全球经济的快速增长，石油等化石能源大量消耗、日益匮乏。由藻类制成的绿色可再生燃料因与原油的化学成分相似，被认为是很好的替代燃料。品种繁多、不需新建昂贵的基础设施、满足军事和航空领域的技术规范、原料生长环境多样化、可减少温室气体的排放，都将成为藻类生物燃料市场的推动因素。
迅速商业化是关键
弗若斯特沙利文指出，预计在未来20年中，世界可再生燃料需求量的增长率将达60%，这将对藻类生物燃料市场起到极大地推动作用。对藻类燃料市场而言，大幅削减成本以实现商业化生产和减少潜在的碳排放量是未来的发展趋势。因此，开发新技术、与大公司合作、迅速实现商业化是藻类生物燃料公司成功的关键。
藻类生物燃料市场主要由北美和欧洲公司主导，同时印度、以色列和中国的一些企业也在不断扩展业务。总部位于旧金山的Solazyme公司独特的暗发酵技术，可以大规模地将藻类快速有效地转化为生物然料，今年该公司有望为美国海军提供超过2万加仑的燃料；总部位于科林斯堡的Solix生物燃料公司是唯一一家藻类生长系统技术供应商，用于控制光合反应器中微藻的培养环境，其光合反应器可生产开放池系统7倍的生物燃料量；总部位于圣地亚哥的Sapphire能源公司，于2008年成功地由藻类生产了符合美国社会检测和材料认证标准的91#汽油，2009年其生物燃料参与了波音737-800飞机的试飞，并为世界第一台越野旅游车提供了藻类绿色燃料。
生产方法多种多样
藻类具有分布广泛、油脂含量高、环境适应能力强、生长周期短、产量高等特点，目前用于生产藻类的方法主要有光合反应器法、开放池法、发酵容器法、浮动农场以及离岸生产。
光合反应器是指用于藻类培养的封闭系统，所需的营养物质、二氧化碳以可控方式提供。封闭光合反应器因其全年的高密度而更高效，但为实现系统的可扩展性，光合反应器需克服一系列环境障碍，如供应水缺乏、大分水岭持续用水的影响、潜在的高电力投入等。
开放池法是指用于藻类培养的浅水池塘，养分由附近土地的径流水或水处理厂的通道水提供。通常情况下，池内水在桨轮结构作用下完成混合。开放池系统的可持续培养面临一定挑战，特别是在水资源稀缺、生态系统面临危险、水处理等相关环境效益缺乏的地区。
暗发酵容器比其他培养系统更易扩大规模，因为水和光的投入不会增加系统设计的困难。暗发酵系统可扩展性所面临的挑战是潜在的环境成本及有机基质原料的季节性。
用浮动农场中的大藻生产生物燃料收益比微藻低，也很可能因为插入现有水体的屏幕、过滤器转移河水的自然流向而影响水生生物。
海藻培养的另一种方式为离岸生产，优点是藻类生物生长的位置扩大、支撑结构材料的使用减少、反应器体积增大、拥有较好的光接触、免费的温度控制以及免费的生物培养搅拌。
发展面临诸多挑战
总体上看，廉价且丰富的藻类生物燃料有望成为国际原油资源稀缺价格居高不下的有效解决办法。此外，大规模藻类生物燃料的生产还将带来数以千计的直接或间接就业机会。因此，藻类生物燃料很可能成为未来最重要、最高效的可再生能源之一。但是市场的发展同样面临着诸多挑战，主要包括：转基因生物或更好藻株的筛选、藻类脂质含量的提高、半透明藻类自身阴影影响的减弱、培养环境中对其他菌株容忍力强的藻株培养、大规模藻类生物燃料生产所需大量二氧化碳的供给等。同时，藻类的可持续培养还应考虑水和土地的使用，生物多样性对生态系统健康的潜在影响、基础设施建造安装、材料毒性、电力需求及废物处理等诸多问题。
另外，资本是藻类生物燃料公司面临的最严重问题。2009年的经济低迷以及金融市场的波动阻碍了私人投资者对藻类生物燃料项目的投资，整个市场需要更多的先进技术及赠款资金以降低工程造价。转基因生物的条例也将延迟藻类生物燃料的商业可行性，由法规变化引起的未来补贴和税收的不确定性，大规模产量商业化的不确定，都将限制藻类生物燃料市场发展。
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