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“2008年－2012年，除了2011年CDM收入实现盈利外，累计亏损5365万元” 江苏国信如东生物质发电有限公司办公室主任董德勤告诉记者，他指出原料成本上涨是亏损原因之一。生物质能被称为世界第四大能源，得到了国家政策的大力扶持，但是在这一朝阳产业背后，却一直存在原料不足的难题，中国农村能源行业协会生物质能专业委会秘书长肖明松也告诉记者，原料收集难已经是整个行业面临的问题。
生物质能企业的原料供应是一个复杂的供应链条，包括收购、加工、储存、运输等环节。健全秸秆收储运体系是提高秸秆综合利用率的关键，农业部生态总站副站长王久臣在接受媒体采访时就曾这样表示。记者在调查中也发现，生物质能企业在原料收集的收、储、运三个环节中的确存在很多问题。
资源分散收购难
生物质能企业的原料目前主要来自农作物废弃物，如秸秆，包壳等，据了解，我国每年产生各类农作物秸秆8.4亿吨，其中除5亿多吨用于还田、养畜、农用之外，多数被就地焚烧，最终用于能源燃料所剩无几。
并且，我国生物质资源分散，电厂收购原料普遍采用自由经纪人收购模式，即在电厂和原材料之间设立代购点。在这种模式下，农民的“积极性并不高”，江苏某生物质发电厂燃料负责人告诉记者，以麦杆为例，“电厂可承受的秸秆收购价平均在每吨260元左右，但是经纪人向农民收购时每吨在120元到180元”，而且每两亩地才能产出一吨秸秆，这对于农户来说费时费力。同时，电厂对经人约束力较小，也容易出现坐地起价和运料掺假等问题。
运输成本不断上涨
即使发电厂有原料可收集，运输成本高企，也是企业面临的阵痛。以秸秆为例，秸秆质量轻、体积大，导致运输车辆经常超宽超高，经常被公路收费站罚钱，另外部分地区也没有开辟秸秆运输“绿色通道”，过桥、过路费是一块不小的费用。
随着燃油费、人工成本不断攀升，运输成本也呈上升趋势。董德勤告诉记者，以运输距离40公里为例，08年农用车每吨秸秆的运输成本32元左右，而现在是每吨40元左右，农用车一次可拉6至8吨，那么运输一次成本就涨了60元左右。如果是长途大车运输，成本将更高。
原料储存风险高
原料储存，是原料供应链的关键环节。要储存，就要占地。以江苏地区为例，一个收购站平均占地3到5亩，每年每亩租金达1000到1200元。
原料储存不仅占地而且风险较高，原料如何安全储存不仅关系到企业的经济效益，也关乎到安全生产，是需要企业科学设计的。以玉米秸杆为例，其中所含水分和糖分都很高，在储存时容易滋生大量微生物，这些微生物活动过程中释放出的热量，很容易引发火灾，因此原料运到各电厂仓储点时所含水分必须控制在20%以内，并且董德勤告诉记者，生物质发电燃料品种繁多，建立一套标准体系相对复杂。
生物质发电与光伏发电、风电“靠天吃饭”相比，原料是关乎行业发展的致命环节，“燃料成本已经占到总成本的70%，” 董德勤如是说。所以构建原料收购网络体系，健全原料收储运体系对于控制成本至关重要。“原料资源分散，收集成本有又很高，如果没有专门的收储运机构运作的话，运料收集是很难的” 肖明松如是说。
收储运体系建设，是企业长期不断探索和积累的过程，但仍需政策外侧发力。从《可再生能源法》到《生物质能源科技发展“十二五”专项规划》再到《关于加强农作物秸秆综合利用和禁烧工作的通知》，国家对生物质能源利用的鼓励政策并不少，但“这是大的政策方向，缺乏具体的实施办法和配套细则，针对秸秆收贮运体系建设的配套制度和扶持政策尚未出台。”肖明松还提出，生物质能产业的健康发展，需要当地政府配合企业建立一套完整的服务体系，“因为当地政府比企业更了解当地资源情况”。