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同时肝炎急性期，胃肠道粘膜出现水肿，甚或粘膜表现变性，影响胃肠道的消化功能。另外 ，由于肝脏功能受损，与消化相关的一些酶的生成和分泌减少，活性降低，所以食物的消化吸收受影响。
肝炎还可以导致胃肠的动力学改变，使其蠕动功能减退，导致胃肠排空延迟。因此，病人饭后常有上腹胀闷感。