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关于L-型细菌尿路感染的发病机理,多数学者认为,与长期大量使用作用于细胞壁的抗生素有关。在临床治疗中,常有这种现象,急性尿路感染在用抗生素治疗后,往往转为慢性或反复发作,其机理可能与部分细菌转变为L-型有关。如抗生素使用不当,不仅不能杀灭细菌,反而诱导L-型细菌的形成,导致耐药菌的出现,这是临床上尿路感染迁延不愈的原因之一。另外,体内的抗体、补体、溶菌酶、肾髓质的高渗、尿液中的高浓度尿素、低pH均可诱导细菌变为L-型。L-型细菌在低渗或等渗培养基中不易生长,而能在肾髓质高渗环境下存活与返祖,引起尿路感染的复发,故尿液L-型细菌培养尤为重要。细菌的许多致病性与细菌细胞壁的成分有关,失去细胞壁的L-型细菌仍有一定的致病性,也有人认为L-型细菌的致病性与其返祖有关。L-型细菌的持续存在则与疾病的慢性过程有关。