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执业医师资格考试制度实行多年来，对人员准入、医疗技术水平的提高发挥了重要的作用。目前，执业医师资格考试制度有些方面脱离基层实际，造成基层无资格人员增多，但他们的实际工作能力并不差，而且基层卫生工作也离不开他们，给基层工作带来了很大困难。
对基层医护人员来说，考试通过率低仍是一个不容小视的问题。执业医师资格考试是全国统考和统一划定分数线，但是基层医务人员总体水平低于大医院人员，因此基层人员考试通过率较低。而未通过考试者就不能单独执业，有的地区甚至规定医学生毕业后2～3年未取得执业资格就要被清退。这样一来，一方面加剧了基层医疗单位人员短缺，另一方面也造成了资源浪费，国家花了大量财力培养的医学人才就这样被荒废了。
要想改变现状，国家应该考虑对不同层次人员划定不同的合格分数线，适当降低基层合格线。如划分为省地级以上、县乡级和乡村医生级三个不同档位，这样能提高基层人员通过率。也可以根据上面三个层次分开考试，降低基层人员的考试难度。把原来实践技能考试合格方可参加医学综合笔试的规定，改为按实践技能考试和医学综合笔试合计总分来划定合格线，建议实践技能考试和医学综合笔试各占50%。
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