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北大医院领导十分重视流感的防控工作，及时转发了卫生部《甲型H1N1流感诊疗方案（2009年试行版第一版）》、《甲型H1N1流感病例转运工作方案》、《甲型H1N1流感医院感染控制技术指南》、卫生局《关于开展流感样病例甲型流感病毒实验室筛查监测工作的通知》、《关于开展流感样病例甲型流感病毒实验室检测工作的通知》和《关于我市儿童流感样病例开展甲型流感病毒检测等工作的通知》等各种防控文件。 早在4月29日，北大医院就组织感染疾病专家翻译参考美国CDC资料，对全院职工进行了紧急培训，200余名医护人员参加，在第一时间学习了流感的防控知识。此后，院领导多次组织各部门有针对性地开展人员培训（发热门诊、急诊、儿科、感染疾病科、抗感染病房、检验科、放射科、总务处等），召开工作会讨论工作方案及落实防护物资和物品，加强督导和检查，反馈检查中的问题并实施整改。 在借鉴成功抗击SARS和禽流感等历次疫情工作经验的基础上，北大医院于5月8日发布《关于进一步讲强流感防控有效应对甲型H1N1流感疫情工作方案》，组建甲型H1N1流感领导小组，由院长刘玉村和党委书记刘新民担任组长，副院长金杰和院长助理潘义生担任副组长，全面领导北大医院防治甲型H1N1流感疫情工作，监督各部门落实预防控制预案，指挥医疗资源的重组，细化了各行政部门岗位职责和临床科室及医务人员职责，包括医务人员、抢救仪器、诊疗药品、防护用品等的调配等。同时成立专家组，负责院内病例的会诊、提出治疗方案，为领导小组提供技术支持。根据卫生部的新要求，北大医院于5月11日和5月18日两次及时调整、修订工作方案，不断完善防控体系。
北大医院还有力地配合国家和北京市的疫情防控工作。卫生部流感3名专家组成员都是北大医院的感染疾病防控骨干，尤其是“五一”期间，感染疾病科徐小元教授作为卫生部甲型H1N1流感专家组组长主持编写了上述一系列卫生部相关技术文件。北大医院专家至今已参加部级会诊6次，包括5月10日呼吸内科王广发主任飞赴四川参加我国首例确诊病例的会诊和防控指导工作。同时，北大医院及时组织感染管理专业、急诊专业、呼吸专业和重症医学专业等共6名专家、3名护士承担市级流感救治专家组会诊任务和流感预备医疗队工作任务。5月18日起，北大医院还承担北京市流感样病例甲型流感病毒检测网络实验室工作任务，负责丰台区、石景山区的流感样病例病毒样本每日10份的筛查工作。
5月14日晚8时，一名18岁女性患者因发热、咽痛来北大医院发热门诊就诊。该患者在美国纽约州某大学学习，11日乘飞机回国，13日出现发热、咽痛等流感症状。正是由于领导重视，组织严密，防控措施到位，医务人员训练有素，北大医院发热门诊经流学病学史、流感症状认真排查，诊断为疑似甲型H1N1流感患者，按照规定流程上报西城区疾控中心，经现场流调、取样，于凌晨2时将患者转至地坛医院，患者母亲在北大医院发热门诊医学观察。16日，患者被确诊为北京市首例、我国第三例输入性甲型H1N1流感病例，其母也转往地坛医院继续接受医学观察。经北京市疾控中心流调确认，北大医院医务人员标准防护措施到位，不需进行隔离。目前两位密切接触者均无流感症状。
为此，15日、18日，刘玉村院长亲自主持召开了两次院内疫情防控工作会议，简化发热门诊流程，取消三线医生值班，由二线医生决定启动北大医院会诊专家组，确保患者及时诊治。其次，全院医护技工人员，在一线工作者一律戴口罩；病房、诊室、治疗室等场所通风，消毒到位；各科室设专人负责，每天监测职工体温等情况，发现异常，上报保健室。北大医院专家组成员手机24小时开通，并在会诊工作结束后向医务处长汇报。与此同时，加强对外包工作人员的管理，培训到位，落实监督工作。目前，北大医院全体员工已经具备了高度的责任感和熟练的技能迎接流感疫情的考验！ （北大医院 医务处）