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2009年 3月3日下午，院校机关召开全体干部大会，切实落实学习实践活动整改措施，部署机关组织机构改革工作。大会由院校党委副书记林长胜主持，院校党委书记李立明做《加强院校机关组织建设工作的方案（征求意见稿）》报告。
为落实院校科技体制改革方案，院校机关2005年进行了组织结构调整和人事制度改革。通过改革，初步实现了提高管理水平和效率，促进院校事业全面发展的目标。近年来，随着国家医药事业的不断发展，院校的任务也发生着重要的变化，目前机关的机构设置和人事制度已不能很好地适应院校事业发展的需求，需要进一步调整和完善。在深入学习实践科学发展观的活动中，广大干部职工也对院校机关进一步完善组织建设、有效发挥综合管理和服务基层的职能提出了更高的期待。
李立明书记在报告中指出，以“有利于院校事业的发展，有利于加强党的领导与建设，有利于工作效率和管理水平的提高，有利于调动干部职工的积极性”为指导思想，统筹兼顾，加强和改善院校机关的组织建设，为实现院校的总体发展目标和发展策略提供有力的保障。通过加强和完善院校机关的组织建设，进一步处理好机关建设与科技体制改革的关系；机关建设与教学实体化的关系；机关部门设置与人员编制的关系。通过配套政策的建立，形成有效的考核与激励机制。建设一个“职能完善、精简高效、和谐发展”的机关，更好地适应院校的发展，更好地为基层服务。
大会结束后，该《方案》（征求意见稿）下发到院校机关各处室，进一步征求意见。