在日前召开的上海市医学会成立90周年庆典大会上，对2006年度上海医学科技奖获奖者进行了颁奖，全市共61个项目获奖，其中一等奖5项、二等奖15项、三等奖41项。我院获得3个一等奖、7个二等奖和22个三等奖。
我院系统获得一等奖的项目和单位分别是：附属瑞金医院、基础医学院、公共卫生学院程琦等合作的“神经免疫性疾病流行病学及多发性硬化的病理机制研究”；附属仁济医院黄钢等与北京华亘安邦科技有限公司、复旦大学附属华山医院合作的“13C呼气试验方法学研究及相关仪器、试剂国产化与
临床应用”；附属第一人民医院许迅等的“
糖尿病视网膜病变的发病机理研究及防治”。
获得二等奖的有：附属仁济医院吴志勇等的“
肝硬化门静脉高压症的发病机制与治疗研究”；附属第九人民医院蒋米尔等的“下肢动脉严重缺血性疾病的实验研究和临床应用”；附属瑞金医院沈卫峰等的“药物洗脱支架治疗高危复杂
冠心病临床研究”；附属瑞金医院彭承宏等的“原位辅助部分肝移植的临床应用和基础研究”；附属瑞金医院、上海市内分泌代谢病研究所罗敏等的“2型糖尿病、肥胖及其早期心血管、肾脏病变相关基因的筛查和初步功能研究”；附属儿童医院曾凡一等的“干细胞在异种移植动物体内的分化及肝组织损伤修复的研究”和附属新华医院苏肇伉等的“复杂先天性心脏病个体化外科技术研究”。
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