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与RNA研究相关的科技词库将被开发

来源:中国科技信息网Chinainfo
摘要:据生物网3月21日报道,自从科学家们发现了核糖核酸(RNA)对遗传学、人类生理机能和疾病以及有机体生长的重要作用后,针对被称为“生命基石”的RNA的研究开始蓬勃发展。当研究结果越来越多的同时,科学家们发现需要开发出一种共享的词库和知识库,对来自全世界各地的研究结果进行说明、分类和分析。来自一个名为“RNA本体......

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        据生物网3月21日报道,自从科学家们发现了核糖核酸(RNA)对遗传学、人类生理机能和疾病以及有机体生长的重要作用后,针对被称为“生命基石”的RNA的研究开始蓬勃发展。当研究结果越来越多的同时,科学家们发现需要开发出一种共享的词库和知识库,对来自全世界各地的研究结果进行说明、分类和分析。

        来自一个名为“RNA本体联盟”的国际机构的科学家已经开始着手进行这种词库和知识库的开发。

        “我们联盟会开发出有关RNA结构以及功能的通用词库以及科学概念来帮助全世界的RNA研究者可以更好地相互交流,同时也可以帮助收集总结他们在核糖核酸分子研究方面所发现的各类信息,”负责这个项目的尼尔科博士说。他是一位化学教授,来自美国保林格林州立大学。

        他还说:“词库开发完成后,把分子信息转化成有用的资料将变的十分简单,我们届时就能了解RNA如何影响细胞的生长,这意味着我们将攻克治疗遗传性疾病的难题。”

        美国国家科学基金会已经将这个项目列入了研究协调网络,并且为这一将历时5年的项目提供了50万美元的经费。美国国家科学基金会的目标是“鼓励并培养科学家之间的相互交流”和促进“有助于实现新的沟通策略的创新意识”的发展。

        负责人尼尔科博士的角色可以说是联盟的协调者,协调来自世界各地的科学家包括美国、英国、法国、加拿大和澳大利亚等国家。这些一流的学者均来自知名大学例如斯坦福大学、杜克大学、耶鲁大学、罗特格斯乔治亚科技大学、加利福尼亚-伯克利大学、北卡来罗那大学、洛彻斯特大学、蒙特利尔大学、劳伦斯-伯克利国家实验室、斯克利普斯研究院以及一所法国的生物技术学院。

        创建《RNA本体论》需要结合化学家、分子生物学家、基因学家、信息学家和结构生物学家通力合作。为了把艰涩难懂的概念性资料分类整理,该联盟将频繁地组织各种RNA科学家的见面会。与会者将在每年的RNA研究年会上公布自己的研究进度,同时了解其他研究者的反馈和相关资料。

        该联盟的研究将确认所有有关RNA的概念,也可以说是重复的模式资料,包括出现在文献中或数据库中的资料,把它们以定义的形式统一起来。开发结果将在保林格林州立大学的网站上发布,RNA研究机构以及研究者们可以通过互联网访问这些资料。

        有些研究者主要研究RNA的分子序列,而其他一些研究者重点放在RNA三维结构的研究上。这两个方向的资料是这个项目的开发重点。

        尼尔科博士在这两方面都是专家。作为保林格林州立大学生物分子研究中心和俄亥俄西北生物信息联盟的会员,他是RNA生物信息结构研究——这门学科综合了生物学、计算机科学和信息技术——的权威人士。他开发的分析RNA分子的结构并进行分类的方法已经受到全世界学者的认可,推动了RNA分子结构预测以及RNA序列的分析和模拟方面的发展。他的研究经费主要来自美国国家卫生学院和美国化学协会。

        尼尔科博士形容RNA分子就像“能够控制基因表达和产生蛋白质的软件”。这种分子不仅可以储存传播信息,而且可以处理信息。

        随着越来越多拥有新功能的RNA分子被发现,科学家们已经意识到RNA的作用要比先前预测的重要的多。例如,基因学家之前发现黑猩猩和人类有99%的蛋白基因相同,可是两年后,他们发现老鼠的蛋白基因也同人类相似。

        人类和老鼠的“硬件”(蛋白质)基本相同,但是两者的形态等又截然不同。这样一来,既然“硬件”相同,那么必然是“软件”不同才导致有这样的差别——软件可以决定如何使用硬件。尼尔科博士说:“而RNA正是人体中的软件。”

        他表示,新开发的知识库的用途很广,现在RNA科学在对了解正常与非正常新陈代谢、生理学的研究和新基因疗法的开发都至关重要。



        英文原文链接参见:http://www.bio.com/newsfeatures/newsfeatures_research.jhtml?cid=9300014
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