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人类基因组中新发现的microRNA

来源:生物通
摘要:6月19号NatureGenetics网络版报道说以色列科学家鉴别出的microRNAs可能是首批灵长类动物特有的microRNA。新鉴别出的89个新microRNA使已经测序的人类microRNA的数量增加了一倍。”他们认为这些新的microRNAs意味着在人类基因组中还有数以百记的未知microRNA等待发掘。近年来成为研究最热点之一的microRNAs是一类大约22个核......

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        6月19号Nature  Genetics网络版报道说以色列科学家鉴别出的microRNAs可能是首批灵长类动物特有的microRNA。新鉴别出的89个新microRNA使已经测序的人类microRNA的数量增加了一倍。罗赛塔基因组学协会(Rosetta  Genomics  in  Rehovot)的研究组领导人Isaac  Bentweich表示:“这些灵长类特异的基因簇对于研究生物进化有着重要意义,并且也有重要的诊断和治疗潜景。”  

        他们认为这些新的microRNAs意味着在人类基因组中还有数以百记的未知microRNA等待发掘。

        近年来成为研究最热点之一的microRNAs是一类大约22个核苷酸长的单链RNAs,它们通过靶定特异mRNAs来调控基因表达。编码microRNA基因的DNA序列包括microRNA,以及当转录时形成双链RNA发夹结构的辅助序列。

        在过去的研究中已经发表的222个人类microRNAs中只有86个科学家已经确证了其序列。为了获得更多的信息,Bentwich和他的同事们通过计算机在整个人类基因组中“换算”出1千1百多万个大小约55个核苷酸或更长、可折叠为发夹结构的序列。其中434,239个看起来可能会是有功能的microRNA。

        Bentwich和他的同事从最初的40多万个潜在的microRNA挑选了首批5,300个“代表”,借助高通量生物芯片在胎盘、睾丸、胸腺、前列腺和脑组织中进行筛选,发现其中886个有表达。通过选择其中359个进行克隆与测序,研究者们鉴别出89种新的microRNA。

        Bentwich和他的同事从这些结果中推断人类基因组有至少800个microRNA。2003年the  Whitehead  Institute和MIT的Burge和David  Bartel实验室曾经估计人类microRNA的数目不超过255,但随后,他们自己以及其后的研究者都认为这个数字偏低。

        新发现的microRNAs中的53个是属于灵长类特有的两个大基因簇,这显然不同于此前已知的其他人类microRNA基因簇――那些簇在所有哺乳动物都有。两大基因簇的其中一个簇定位在19号染色体上,并且只在胎盘中表达。它是目前为止报道过的最大的microRNA簇,包括54个新的microRNA。第二个基因簇定位在X染色体,包括10个在microRNA,它们只在睾丸中表达。

        Burge认为,未来的挑战是如何去推测非保守性microRNA(nonconserved  microRNAs)的靶目标。“对于进化上保守的microRNA,我们已知数以千计的保守的mRNA可能是他们的调控目标,但是对于非保守性的microRNA,我们还什么都不知道。
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