微生物中的RNA谜团

随着DNA长序列测序目标的实现，以及基因组、基因扩增产物的唾手可得，科学家们逐渐将研究的视角转向RNA：细胞中高度灵活、难以驾驭的生物聚合体。之前，它们在科学家们眼中只不过是一些信息载体（信使RNA和转运RNA），或偶尔具有功能的结构上的大分子（核糖体RNA）。但现在，一些非编码微小RNA、小干涉RNA分子，以及核糖开关（参见备注1）的发现逐渐占据了这个研究舞台的中心。

Puerta-Fernandez等对生活在极端环境（如强酸碱、高盐、高温）下的15种微生物的RNA进行分析，发现一条高度保守的非编码的长RNA序列（大约600个核苷酸）。通过对保守序列的二级结构分析预测出凸出(bulge)或环(loop)中存在很多保守区，暗示着此RNA的三级结构起着功能性抑制的作用，但至今为止它的作用仍是一个谜。该序列的附近基因都没有参与代谢途径的，但紧随该基因之后的下游序列中有个预计表达膜蛋白的基因，RNA可能可以与它形成复合体。  



备注1：

riboswitches；在小分子诱导下发生构象改变，进而调控基因表达。



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Proc.  Natl.  Acad.  Sci.  U.S.A.  103,  19490  (2006).