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2011值得关注的技术:RNA结构

来源:生物通
摘要:《NatureMethods》盘点2011年度技术,选出了最受关注的技术成果:人工核酸酶介导的基因组编辑(genomeeditingwithengineerednucleases)技术。除了基因组编辑以外,《NatureMethods》也整理出了2011年最值得关注的几项技术,分别为:单细胞技术(Single-cellmethods)、功能基因组资源(Functionalgenomicresources)、糖......

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《Nature  Methods》盘点2011年度技术,选出了最受关注的技术成果:人工核酸酶介导的基因组编辑(genome  editing  with  engineered  nucleases)技术。  

除了基因组编辑以外,《Nature  Methods》也整理出了2011年最值得关注的几项技术,分别为:单细胞技术(Single-cell  methods)、功能基因组资源(Functional  genomic  resources)、糖蛋白组学(Glycoproteomics)、单倍体因果突变(Causal  mutations  in  a  haploid  landscape)、单层光生物成像(Imaging  life  with  thin  sheets  of  light)、非模式生物(Non–model  organisms)、光基础电生理学(Light-based  electrophysiology)和RNA结构(RNA  structures  )。

RNA结构,尤其是RNA转录复合物的结构研究,已经引起了不少科学家们的关注,2011年RNA结构精确分析方法取得了一些重要进展。

虽然RNA转录体合成的时候是线性结构,但是其折叠后的结构在细胞生理机制作用中扮演了重要角色。现代生命科学研究表明,RNA的作用远不止是信使,传递信息,或者作为核糖体中的RNA成分。像是RNA剪接和编辑,维持端粒,蛋白分泌表达,小分子感应和应答催化,都是近年来发现的RNA的新功能。RNA如何行使这些功能,是解开许多生物学作用迷题的关键,而要回答这个问题,常常需要依赖于解密RNA结构。

但是要了解RNA的结构,并不容易,许多RNAs保守性不高,其功能不能通过简单的同源筛选就可以发现,因此常常采用的是二级保守结构的公变分析,还可以用于功能三维RNA模块的计算机模拟预测。

首先为了解密RNA二级结构,研究人员采用了一些高通量的实验方法,2011年麻省理工大学布罗德学院开发了一种高分辨率新技术,可以瞄准一个特定细胞,研究所有RNA的变化过程。通过在极短的时间间隔内给RNA拍摄快照,并将这些照片连在一起,不仅能显示出RNA的数量变化,还能看到其生命周期中短暂的中间过程。研究小组将这种追踪新生RNA生命周期的技术与一种新的测序技术结合,就能计算出mRNA(信使RNA,携带遗传信息,在蛋白质合成时充当模板)的数量。

这一新技术的一个关键应用是跟踪如癌症或其他影响到RNA生命周期的疾病中的基因突变。过去人们只知道发生了突变,而要看到细胞里分子过程中所发生的突变结果却非常困难。新技术能让研究人员深入透视到细胞内部,看到基因突变如何扰乱了RNA的数量水平,反过来又合成了哪种蛋白质。

(生物通:万纹)
作者: 2012-1-14
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