2011年6月3日，美国加利福尼亚州卡尔斯巴德市——Life Technologies公司今天宣布，使用Ion Personal Genome Machine (PGM™)与德国明斯特大学医院合作进行的DNA测序得出的初步数据有力地表明，一种新混合型致病大肠杆菌菌株是导致德国致命
疫情的原因。
从DNA测序仪获得的数据显示，典型的基因存在于两种不同类型的大肠杆菌中：肠聚集性大肠杆菌（EAEC）和肠出血性大肠杆菌（EHEC）。研究人员目前正通过Ion PGM™对结果进行进一步的数据分析和确认。这些结果有助于了解这种细菌的侵略性并阻止疫情进一步爆发。
“快速全基因组测序结果使我们在几天内发现细菌毒力性状的独特组合……使德国经过此次疫情爆发克隆了一种来自不同大肠杆菌致病变型的独特混合类型，”德国明斯特大学医院卫生研究所德国国家溶血尿毒综合症（HUS）咨询实验室的科学家Alexander Mellmann博士说。
Life Technologies公司位于德国达姆施塔特市的实验室收集的数据将被明斯特大学医院的科学家用于开发更好的测试手段，以积极地识别这种表现为肾衰竭和出血性腹泻的传染性疾病。这是自疫情爆发以来人们第一次能够详细研究这种菌株致命性如此之强的原因。
Life Technologies公司负责此次测序工作的Simone Guenther博士说：“此次疫情爆发的严重性意味着一定要速战速决。我们破纪录地迅速为明斯特大学医院提供了数据。在先前的疫情爆发中我们肯定需要比现在长得多的时间来达到这一阶段。”
为了防止细菌的进一步传播，Life Technologies公司本周开始向欧洲的实验室运送其定制的大肠杆菌检测试剂盒，用于筛选疫情爆发中心被认为污染的食物。此次欧洲的疫情爆发已造成17人死亡，1000多人感染。
这些试剂盒是第一道防线，用以检测致病性大肠杆菌是否存在。之后研究人员会使用更细化的试剂盒进行第二轮检测。未来几天内，一旦测序数据分析完毕，Life Technologies公司便将开发用于检测德国这种混合型菌株的新定制试剂盒。公司可在一周内开发出定制的
化验剂。
运往欧洲的试剂盒是大批Life Technologies公司研制的分子化验剂的一部分。这些产品可准确检测出绝大多数危害人类的病原体。Ion PGM™是一种采用半导体技术的DNA个体化操作基因组测序仪，它可以在短短两个小时内完成高通量和高精确度的DNA测序。用于此次测序的DNA样本采集自一位患有这种疾病的病人。
Ion Personal Genome Machine测序仪仅可用于研究用途。该仪器测序以快速著称，可以在两个小时内完成相对高通量的测序通量，并得到精准的测序结果。
作者：
2011-6-3