由于“蛋白数据库”(Protein Data Bank)现已有超过6万个结构,所以经常有可能创建基于同源性的模型,来帮助确定具有一个未知三维结构的某一蛋白的X射线晶体结构。但当人们所感兴趣的蛋白的序列与已知结构的符合程度不到30%时,当前的方法通常会失败。一种能够克服这一局限性的新方法已经建立,并成功地用在了13个X射线衍射数据集的8个当中,它们用传统方法是不能得到解析的。只要分辨率为3.2埃或更好,在非对称单元中有四个或更少的版本,且已有“序列身份”符合度超过20%的同源蛋白的结构,那么在当前方法会失败的一半以上的情形中,该新方法应能在没有实验“相信息”的情况下快速确定蛋白的结构。
作者:
2011-6-10