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可预测病毒抗药性的HIV检测

来源:生命经纬
摘要:杜克大学医学中心的研究者开发出了一种高度敏感的检测手段,可以准确识别出艾滋病病人体内病毒产生抗药性的突变位点。“这个检测将为内科医生选择合适的治疗方案提供依据,因为它可以预测出一种药物在某个病人身上是否有效”,该检测的开发者之一FengGao介绍说。药物抗性的产生是HIV治疗不成功最为常见的原因之一。“检测......

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杜克大学医学中心的研究者开发出了一种高度敏感的检测手段,可以准确识别出艾滋病病人体内病毒产生抗药性的突变位点。该研究成果发表在2007年1月7日在线《Nature  Methods》杂志上,将于2月份发表在印刷版上。此项研究由美国国立卫生研究院和杜克爱滋病研究中心资助。

“这个检测将为内科医生选择合适的治疗方案提供依据,因为它可以预测出一种药物在某个病人身上是否有效”,该检测的开发者之一Feng  Gao介绍说。药物抗性的产生是HIV治疗不成功最为常见的原因之一。

“检测还会反映出HIV病毒内发生的遗传变异或者突变的情况,这将有助于科学家理解该病毒不断进化出抗药性的分子机制,”Gao说。他认为这些知识的累积将有可能促使开发出一套新型疗法,从而规避病毒的抗药性。

因为HIV基因极易突变,而且病毒的增殖速度很快,一些感染HIV的病人身上往往有着不同类型的HIV病毒。在一些病例中,突变的病毒株产生了抗药性,抗逆转录病毒疗法(antiretroviral  therapy)不再行之有效,而该疗法是目前最主要的治疗手段。

“病人间的病毒类型差别可以很大,”Gao说道,“而这种差异性也为我们治疗不同病人提供重要线索。”现在用于治疗HIV感染的20种药物中,除了一种药物外都是针对HIV病毒的关键性蛋白(逆转录酶和蛋白酶)起作用的。

杜克大学的研究者仔细检查了HIV突变引起的抗药性情况。例如,在蛋白酶基因的遗传密码上46位点发生突变后,将使得病毒对茚地那韦(indinavir)产生抗药性。

为了评价检测的可靠性,研究者分析了来自三个不同治疗背景的HIV病人的血样:从未接受抗逆转录病毒治疗的;过去接受过治疗,但现在没有;正在接受治疗,但是治疗效果没彻底成功的。

对血样作适当处理后,研究者从中分离得到遗传物质,并将一些荧光标签加入到遗传物质中。按照设计方案,那些特异性结合突变基因的标签会发绿色荧光,特异性结合同样的基因区域但是没有突变的则呈现红色荧光。

研究者使用了一套高度敏感的电脑系统,它可以从一万个没有突变的病毒群中找出一个发生突变的病毒,通过它检测每个血样中绿色荧光标签或红色荧光标签的数目。详细结果可以参看英文原文。

“除了能检测一个突变位点外,它还可以检测两个以上的位点突变,而现今市场上可使用的检测都做不到这一点。”Gao说道。“因为有些病人在接受治疗时同时服用多种药物,容易产生多位点突变的HIV病毒株。”

“此外,这个检测可能有着更为广阔的医学应用前景,”  Gao说道。“利用同样的原理,我们可以用它来检测导致其他类型传染病的病毒是否发生了突变,如肝炎病毒、肺结核病毒等。”



Source  :  Duke  University  Medical  Center
作者: 2007-1-10
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