仅用了三周时间,游戏玩家就解决了一个困扰科学家好几年的难题。他们通过玩游戏发现了一种蛋白质的结构,这种蛋白质在
艾滋病毒生长过程中起到了至关重要的作用。该发现标志着人类有望在艾滋病毒(HIV)和艾滋病(AIDS)研究领域获得重大突破。这一成果刊登在《自然—结构与分子生物学》(Nature Structural & Molecular Biology)杂志上。
这个游戏就是华盛顿大学的计算机科学和工程学系和生物化学学系联合开发的一个实验性的蛋白质折叠电子游戏——Foldit。
有关Foldit的介绍:
Foldit是一个实验性的蛋白质折叠电子游戏,由华盛顿大学的计算机科学和工程学系和生物化学学系联合共同开发。
Foldit提供一系列教程,让用户试着操纵简单的类蛋白质构造,并定期更新以真实蛋白质结构为基础的谜题。该程序让用户在工具辅助解谜,就能够得出实际的蛋白质模型。每当结构被变动,一个”分数”会根据折叠的完善程度给出。Foldit用户可以创立加入小组,分享各自的方案。也有小组高分榜。
Foldit尝试利用人脑天生的三维pattern matching能力。目前该程序出的谜题都是基于已被人们清楚了解的蛋白质;通过分析人类在解这些谜题时的直觉思考途径,研究者希望能改进现有蛋白质折叠软件所用的算法。
Foldit是结合众包与分布式计算所得的成果。
“很多人尝试通过分子替代的方法解决M-PMV的晶体结构问题,但都失败了,于是我们向蛋白质折叠游戏Foldit的玩家发起了挑战,让他们制作该蛋白质的精确模型。出人意料的是,这些玩家制作的模型质量很高,可成功地用于分子替代和结构判断。这种更准确的结构为设计抗逆转录病毒药物提供了新的见解。”
人类具有空间推理能力,这是计算机所不擅长的。游戏则提供了一个框架,把计算机和人类的优势整合到一起。Foldit首席设计师Seth Cooper说到。
这项通过Foldit取得的突破不仅可用于艾滋病研究,还可用于
癌症和帕金森症的研究。
作者:
2011-12-5