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科学家找到预测基因表达的新方法

来源:生命经纬
摘要:胚胎发育过程就像一个组织良好的建筑项目,而胚胎中DNA则是该项目的图纸,根据图纸控制基因的不同组合,并进行表达实现细胞不同的功能。在基因表达过程中,转录因子通过与顺式调控元件(cis-regulatorymodules,CRMs)结合,调控基因表达的开启和关闭。最近,欧洲分子生物学实验室(EMBL)的研究人员发现,精确的预测不同的CR......

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胚胎发育过程就像一个组织良好的建筑项目,而胚胎中DNA则是该项目的图纸,根据图纸控制基因的不同组合,并进行表达实现细胞不同的功能。在基因表达过程中,转录因子通过与顺式调控元件(cis-regulatory  modules  ,CRMs)结合,调控基因表达的开启和关闭。

最近,欧洲分子生物学实验室(EMBL)的研究人员发现,精确的预测不同的CRMs被激活的时间和位置或许成为可能。这篇研究报告发表在《Nature》杂志上。

研究人员通过全面的、系统的研究方法发现,有大约8000个CRMs参与调节果蝇(Drosophila)肌肉发育过程,EMBL研究人员还对转录因子和CRMs结合模式进行记录,根据肌肉的类型以及发育阶段对这些被激活的CRMs进行分组,通过计算机将具有相似激活模式的CRMs分到一组,CRMs相同的激活模式或许意味着这些CRMs参与调节同种肌肉的发育过程。

研究人员对这种实验预测方法进行测试,发现结果不但非常精确,而且很有启发性。转录因子与CRMs之间结合模式不同或许有相似的激活模式。因此,这种不同的转录因子组合可以调节相同的发育过程的事实也说明,果蝇进化过程中,即使某些转录因子或CRMs发生改变或缺失,也不会阻碍发育过程的进行。(编译:高芳)
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