Literature
Home行业资讯临床快报遗传与基因组

高通量测序技术的发展趋势

来源:生物通
摘要:在本期的《GeneticEngineeringBiotechnologyNews》杂志上,HarryGlorikian和BrianClancy盘点了他们认为值得关注的测序趋势,包括测序活动的两极化、流程价值的转变,以及临床和商业应用。首先,他们谈到了测序活动的两极化,即最大和最小实验室所开展的高通量测序活动的份额正在逐步增加,这是由一系列同时存在的集中和分......

点击显示 收起

在本期的《Genetic  Engineering  &  Biotechnology  News》杂志上,Harry  Glorikian  和Brian  Clancy盘点了他们认为值得关注的测序趋势,包括测序活动的两极化、流程价值的转变,以及临床和商业应用。



首先,他们谈到了测序活动的两极化,即最大和最小实验室所开展的高通量测序活动的份额正在逐步增加,这是由一系列同时存在的集中和分散力量驱动的。最重要的集中力量是研究协作组的出现,他们试图对大量人及其他物种的基因组进行测序和分析,目标是发现新的变异体,并探索它们对于人类健康的意义。他们认为,出现这种趋势的原因是分析大量基因组的经济性。随着样品的增多,样品制备、测序本身以及后续分析的成本有下降的趋势。



而作者认为,分散测序行为的力量则更多更复杂。讨论最多的力量是台式高通量测序仪的出现(即生物通近日报道的个人型测序仪),它们的价格与高端仪器要低得多。这种新兴仪器的扩展性好,且有着更快的周转时间,因此有望在某些应用中取代毛细管电泳技术。



Glorikian和Clancy认为,第二个重大趋势是流程的价值转变,即高通量测序流程中使用了更多除测序仪和消耗品之外的去商品化(decommoditization)和商品化资源。这种趋势的主要推动力是技术本身,并与第二代测序技术的成熟和更新一代测序仪的出现有关。



作者谈到,大型基因组中心在2005年大约花费65%在工具(仪器和消耗品)上,但到了2010年,工具花费则降低至~40-50%。预计今后还会继续降低,因为计算机设施和样品物流设施的投资增加,而且还需要雇佣更多的人员,如生物信息学家和病理学家。



作者认为未来几年的增长点将是样品制备仪器及消耗品,DNA剪切和大小选择仪器及消耗品,亚硫酸氢盐测序试剂盒、染色质免疫沉淀试剂盒、序列富集仪器及消耗品,以及生物信息学工具。



最后,也是生命科学界最感兴趣的一个趋势,是测序技术扩散到临床和商业应用中。这个趋势主要是由两种力量推动的,即不断增长的高性能需求和快速扩展的技术性能范围。



尽管大部分的测序讨论集中在技术的性能改善上,但作者认为,客户需求的变化更为重要,也非常快。从分析的角度来看,愿望是降低假阳性和假阴性,而从临床的角度来看,则是提高阳性和阴性预测值。



他们将测序中最长期和最重要的趋势称为测序技术的无所不能。高通量测序技术将逐步扩散到基因组学之外,进入其他分析物的分析,包括小分子、蛋白和肽段,以及科研、临床和商业应用中的细胞现象。



作者总结道,考虑到整个分析仪器市场的规模(大约400亿美元)以及商业化体外诊断市场的规模(约410亿美元),现有市场参与者和客户的影响将是可观的。如果几台测序仪能够取代整个临床实验室,那么行业巨头最终有可能处境危险。(生物通  薄荷)
作者: 2011-9-8
医学百科App—中西医基础知识学习工具
  • 相关内容
  • 近期更新
  • 热文榜
  • 医学百科App—健康测试工具