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两大机构利用测序新技术发多篇文章

来源:生物通
摘要:来自英国牛津大学糖尿病,内分泌代谢研究中心以及威康信托基金会(WellcomeTrustCentre)人类遗传学项目组的研究人员采用测序新技术,分别发表了两项重要的研究成果:外显子分析研究发现了糖尿病与代谢疾病相关的遗传变异,以及找到了与心肌梗死相关的候选基因。这些研究由牛津大学两大研究机构与PopulationGenetics公司......

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来自英国牛津大学糖尿病,内分泌代谢研究中心以及威康信托基金会(Wellcome Trust Centre)人类遗传学项目组的研究人员采用测序新技术,分别发表了两项重要的研究成果:外显子分析研究发现了糖尿病与代谢疾病相关的遗传变异,以及找到了与心肌梗死相关的候选基因。

这些研究由牛津大学两大研究机构与Population Genetics公司合作完成,Population Genetics公司主要致力于通过多组个体基因组的同步分析,生产可加速大规模群体研究的产品。诺贝尔奖得主Sydney Brenner是这家公司的联合创始人。

在第一项研究中,来自牛津糖尿病,内分泌代谢研究中心的Mark McCarthy教授领导了这项研究,他们利用千人基因组中的DNA样品,分析了12个基因的74个外显子,从中找到了与糖尿病和代谢疾病有关的遗传关联。这项研究采用了Population Genetics公司的GenomePooling技术,能在整个群体中,同时进行包含多基因,和DNA不连续区域的测序,这种方法也可以检查到个体的表达水平。

这项研究也响应了美国NIH的一项倡议——创建一项NIHR BioResource 志愿者工作,用于绘制基因型和表型。

第二项工作由威康信托基金会人类遗传高通量基因组主任David Buck领导,研究组利用Reflex workflow,分析了3000个样品,从中找到了与心肌梗死有关的候选基因的基因变异。目前这一研究组还与另外一项欧洲合作项目:Procardis研究组合作,开展冠状动脉疾病分子机子里的研究。

其中采用的Reflex方法能用于测序大群体中的长连续区域,这样就可以找打与表型有关的基因变异。

研究人员认为,这些研究技术能通过识别人类常见疾病有关的候选基因变异,有效验证研究假设,这样有利于研究成果向临床的转化。

牛津大学糖尿病,内分泌代谢研究中心是一所集临床、科研与教学为一体的糖尿病、内分泌及代谢的研究机构,现任主席是Rury Holman。Holman教授以主席或联合主席身份,主持了多项2型糖尿病防治领域的研究。自1997年英国糖尿病前瞻性研究(UKDPS)启动以来,Holman 教授一直担任主要研究者。

牛津大学威康信托基金会是英国最大的慈善基金会之一,致力于提高公民和动物的健康福利事业。威康基金是英国最大的生物医药研究赞助者之一,也是世界最大的生物医学研究基金之一,与美国的霍华德·休斯医学研究所(Howard Hughes Medical Institute,缩写:HHMI)相比拟。

(生物通:万纹)

作者: 2012-6-20
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