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Science:英国公布大型全基因组测序计划

来源:生物通
摘要:基因分析技术在快速发展,昨日英国首相宣布了一项大型计划,将对患有癌症及罕见疾病的十万英国人进行全基因组测序。现在许多国家都在为治疗疾病而努力解码国民的DNA,而英国这一新项目的不同之处在于,其测序的是全基因组而非基因组个别区域。英国首相DavidCameron在声明中称,英国国民医疗保健体系NHS已经划拨一亿英镑用......

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基因分析技术在快速发展,昨日英国首相宣布了一项大型计划,将对患有癌症及罕见疾病的十万英国人进行全基因组测序。现在许多国家都在为治疗疾病而努力解码国民的DNA,而英国这一新项目的不同之处在于,其测序的是全基因组而非基因组个别区域。

英国首相David Cameron在声明中称,英国国民医疗保健体系NHS已经划拨一亿英镑用于这一项目,这一测序项目预计会持续三到五年。这一项目联合了欧洲等地的许多测序项目和生物信息库。三月份,英国正式开启了包括五十万人健康信息和血样的生物信息库。在二月,挪威也宣布计划测序一千位癌症患者的肿瘤基因组。

英国这一新项目可能还有更深远的意义。“从全基因组测序的规模来讲,这项研究是独一无二的,”麻省总医院研究癌症遗传学的肿瘤学家Leif Ellisen说。目前也有其他全基因组测序项目正在进行,例如纽约的一个项目正在测序一千位阿尔茨海默症患者的基因组,但这些项目涉及的疾病范围较窄而且参与人数也较少。

Ellisen认为英国这一项目面临的挑战是,怎样将大量的DNA数据转化为有帮助的实用信息。Cameron在声明中非常乐观:“通过解密DNA数据,NHS将成为该领域的领头羊,为人们提供更好的检测、更好的药物以及更好的医疗”。这份来自唐宁街十号的声明强调,贡献自己基因组信息的十万志愿者是该项目的直接助力。

迄今为止,只有少数个人从全基因组测序中受益,而且绝大多数都患有非常罕见的疾病。尽管进行大规模全基因组测序“无疑是正确的”,Ellisen说,但对于进展有多快“我们无法承诺太多”。

(生物通编辑:叶予)

随着基因技术的突飞猛进,英国首相于12月10日宣布了一项雄心勃勃的计划,为10万名患有癌症和罕见疾病的英国病人进行全基因组测序。尽管许多国家都宣称正在以治疗和护理病人的名义解码其公民的脱氧核糖核酸(DNA),但这项新的计划却是与众不同的,因为它将解码全部基因组,而并非仅是一小部分。

 

首相David Cameron在一份声明中表示,英国政府的国家医疗服务体系(NHS)已经拨款1亿英镑(约合1.6亿美元)用于这项计划。这些经费是上周宣布的未来数年6亿英镑(约合9.65亿美元)研究经费的一部分。这项测序计划预计将花费3到5年的时间。

 

这项计划联合了欧洲以及世界各地的多项测序计划和生物信息库。今年3月,英国官方公开了其涉及50万人的生物信息库,其中包括健康信息以及血液样本。而在2月,挪威宣布计划对1000名癌症患者的肿瘤基因组进行测序。

 

新公布的计划可以说是更为深远的。

 

在美国波士顿市马萨诸塞州总医院进行癌症遗传学研究的肿瘤学家Leif Ellisen指出:“根据这项全基因组测序的规模和范围,在我听起来感觉相当独特。”

 

还有其他一些全基因组测序工作正在进行当中,例如,一个在纽约进行的项目力图解码多达1000位阿尔茨海默氏症患者的基因组,但是它们在医疗目标和涉及的志愿者数量上都局限性较大。

 

Ellisen指出,英国研究机构面临的最大挑战将是如何把大量的DNA数据转化并生成能够帮助患者的有用信息。

 

在这份声明中,Cameron显得很乐观:“通过解锁DNA数据的能量,NHS将引领有关更好的测试、更好的药物,尤其是更好的护理的全球竞赛。”这份来自唐宁街十号——Cameron办公室——的声明还暗示,那10万名将基因组贡献给该计划的病人将直接从中收益——这被Ellisen称为是“一种延伸”。

 

迄今为止,只有少量个体从他们的全基因组测序中获益的实例,其中大部分涉及的是一些非常罕见的疾病。尽管在这种规模上进行全基因组测序“显然是做了一件非常正确的事情”,Ellisen说,“但我们并不想过多承诺”多快将会有进展出现。

 

全基因组测序是对一种生物的基因组中的全部基因进行测序,测定其DNA的碱基序列。目前,全基因组测序技术主要包括第二代测序技术(NGS)和第三代测序技术。第二代测序技术已经能够快速、低成本地进行全基因组测序。第三代测序技术于2011年4月正式推广,其单分子实时(SMRT)测序技术完全不同于第二代测序,它的序列读长高达3000bp(碱基对)。

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