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寻找癌症和HIV分子标记的新工具

来源:生物通
摘要:研究人员已经设计出一种新的确定细胞中的DNA突变的分子工具,他们将其称之为“LigAmp”。对少量细胞系和体液的初步研究表明这种超敏感检测法有可能能够检测精细的癌症和HIV药物抗性。新检测法的分析结果公布在11月的NatureMethods上。用其它分析检测方法很难在成千上万个细胞中定位出特定细胞中的突变,而LigAmp最大的优......

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        研究人员已经设计出一种新的确定细胞中的DNA突变的分子工具,他们将其称之为“LigAmp”。对少量细胞系和体液的初步研究表明这种超敏感检测法有可能能够检测精细的癌症和HIV药物抗性。新检测法的分析结果公布在11月的Nature  Methods上。

        用其它分析检测方法很难在成千上万个细胞中定位出特定细胞中的突变,而LigAmp最大的优势是能够过滤掉环绕在目标周围的正常细胞造成的“背景噪音”并发现特定的突变。

        这类确定突变的灵敏检测法能够检测疾病高危病人患癌症的情况。这种检测还能帮助确定癌症的复发情况(通过监测突变数目是否超过一定的阈值)。除了癌症检测之外,这一突变检测工具还能够检测药物抗性HIV病毒。研究组用这种方法对来自艾滋病病人的血样进行了检测并且找到了病毒上发生的DNA突变,而这种突变使病毒对一些抗病毒药物产生了抗性。

        这种方法工作的原理是能够创造出一个分子“磁铁”,这种“磁铁”对DNA错误(即点突变)具有亲和力。如果发现了突变,这个磁铁就会与之结合并插入一种细菌基因。这种细菌基因能够充当一个标记并且产生一个能够被计算机程序看见的荧光。

        Hopkins的研究人员还用LigAmp检测结肠癌细胞系、HIV病人血液和癌症患者胰腺管液体,以此对这种方法的准确、灵敏性进行验证。结果发现这种方法能够检测到结肠癌细胞中的单个突变以及对药物产生抗性的HIV病毒。这项技术将会帮助研究人员建立能够筛选和确定低或高水平突变的癌症标记的名单。标记的确定必将提高癌症的检测和治疗水平。而检测HIV抗性的能力可能会促进抗性HIV病毒的治理。
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