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人们对于转基因食品存有安全疑虑，但世界各地对转基因食品的监管政策有所不同。据了解，按照台湾相关法规，对于包装食品，如果转基因原料占比超过5%，必须强制标识。
对于转基因食品是否对人体有害，科学上还没有定论。在台湾，有人认为转基因食品完全安全，但也有人认为会影响生育，还有人认为会影响智力等等。
为了尊重消费者的选择，台湾“食品药物管理署”说，他们对转基因食品的监管分为两种：强制性标识和自愿性标识。按照规定，如果是包装食品，转基因食品成份占总含量超过5%，就必须强制标识，而非包装食品和深度加工食品，则采自愿标识。比如，转基因豆制成的豆腐、酱油、色拉油等，是不需要强制标识的。
台大农艺系郭华仁教授说，像色拉油，一般认为经过深加工后，转基因黄豆的基因序列已经改变；而加工成酱油，黄豆的蛋白质分解为氨基酸，因而不再有安全疑虑，所以不用强制标识。