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疾控系统中常见的色质联用仪主要有气相－质谱联用仪和液相－质谱联用仪。随着我国财政能力的日益增强和理化分析仪器的飞速发展，许多单位处于一个设备快速增长的高峰期，提出买质谱的单位也不少，下面针对疾控系统中色质联用仪的购买与应用问题谈下个人看法。
一 为什么要购买色质联用仪。
从技术层面来说，购买色质联用仪的目的主要有两方面：定性，灵敏度。
谈到色质联用仪在定性方面的作用，就要先谈一下从色谱理论的逻辑缺陷。
色谱定性和色谱定量都涉及到一个基本逻辑：“在两个流程的绝大多数因素都完全一致，则唯一不相同的那一个因素，最终导致了结果的不同”。
色谱定量是依据这个逻辑（在各个条件都一致时，决定峰面积不同的唯一因素就是浓度的不同），色谱定性也是这样（在各个条件都一致时，决定保留时间不同的唯一因素就是组分的不同）。
色谱定性最重要的依据就是色谱峰的保留时间（在绝大多数情况，这甚至是唯一的依据）。我们在定性时的色谱理论就是：“ 组分峰与标准峰保留时间相同，则判断该组分＝标准物质”。注意，我们使用的是“相同”，而上面逻辑中的重点却是“不同”。
要使这样的色谱理论合乎逻辑，必须加上至少一个限定：过程中的每个因素都能对结果产生特异性的作用。对于色谱来说，就是“在定性时，每种不同的组份必须对应不同的保留时间”。
然而，大量的实验结果告诉我们，不同的组份，往往会有相同或极为相近的保留时间。
以上就是我们常说的“色谱定性可靠度不高”的由来，在色谱实验中，不同的保留时间对应不同的组份是成立的，但是反过来，相同的保留时间意味着相同的组份却是靠不住的。
所以在实验中，排除是相当有信心的，而确认则在相当程度上是“靠天吃饭”，有一部分是凭撞大运。
人们很早就意识到了这一点，也在想办法提高定性的准确性，所以有了加标确定法，双柱法，二极管阵列检测器等的运用，在这几种方法中，加标确认法在概念上就不正确，双柱法也近于隔靴搔痒，二极管阵列法能起有些作用，可惜特异性不高，也容易造成冤案。
在色谱中引入质谱技术法后，大大增强了定性的可靠性。
质谱法针对的是分子结构，信息特征且丰富，甚至在一定程度上可以摆脱标准物质的限制。
下面谈下灵敏度。
通用型检测器（如FID和TCD）一般灵敏度有限，特异性检测器灵敏度较好但是检测范围有较大限制，而质谱检测器是一种既通用灵敏度又高的检测器。
灵敏度取决于信号与背景，我们通常理解的增加灵敏度需要通过尽量提高待测物的信号值，作为一种通用型检测器，质谱仪的信号方面没有特别过人之处；但是它的长处却在于它能大大的降低检测背景从而数量级地提高检测灵敏度。
检测背景，是检测器对样品基础成分响应的反应，作为通用检测器，产生响应在因素很多，所以背景会比较高，灵敏度受到限制；而质谱检测器通过对限定结构信息的检测，可以过滤掉大多数不需要的背景信息，例如气质联用的SIM方式和液质联用的MRM方式。
二 疾控系统中常用色质联用仪的类型
出于不同的使用目的，决定购买不同类型的色质联用仪。
气质联用仪的分类有很多方法，按仪器尺寸可以分为大型、中型、小型；按仪器性能，可能分为研究级和检测级两类；按质谱技术，可以分为GC－MS（气相色谱－四级杆或磁质谱），GC－ITMS（气相色谱－离子阱质谱），GC－TOFMS（气相色谱－飞行时间质谱）；按分辨率，可以分为高分辨（分辨率高于5000），中分辨（分辨率在1000至5000之间），低分辨（分辨率低于1000）。
对于一般的用户，最需要关注的在于离子化源，如EI源，CI源，NCI源。
EI源，是我们用的最多的一种，属于最中庸的一种选择。70 电子伏的标准谱库可以提供一个检索未知有机物的可能（如NIST Chemical Structures, Wiley Library, Standard pestcide Library , Pflger Drug Library），这里要注意，我们说的用质谱检测未知物，指的仅仅就是EI源的质谱，其它象CI源的或MS－MS的或者所有的液质，都不能检测未知物。EI源的优势在于官能团的分析。
选择EI源质谱主要目的是进行未知物的检测及常规己知物的检测确认，也适合新手入门学习，只是灵敏度有限，不适合进行甚低含量的检测。
CI源，NCI源，如同一页纸的两面。前者的优势在于得到分子量的准确信息，特别是长链分子，如脂肪酸等，但是这时结构的信息就比较少。后者的优势在于使用时可能对电负性组份达到接近于ECD的水平，比较适合进行有机氯农药的检测与确证，但是它的检测局限性也就比较大。
除离子源外，还有四级杆方面的区别，主要是单四级杆和串联四级杆的区别，配备MS－MS的气质在国内较少。
在真空系统方面，有分子涡轮泵和扩散泵的区别。
常见液质联用仪的分类更复杂一些。离子源就有多种，比较常用的有电喷雾电离（ESI）和大气压化学电离（APCI）等，但是最主要的区别在于检测方式，如离子阱，单极四极杆，串联四极杆和飞行时间等。
离子阱的优势在于比较容易得到丰富的结构信息，对于生化和药物结构方面的实验比较适合，它的缺点在于基本不能定量且TRAP容易污染等，常不适合进行食品分析。
单极质谱可以进行简单的结构分析，也可以进行定量分析，且价格不太高，属于经济适用型液质，对于检测物没有紫外吸收或简单结构判断的常量分析比较合适，但是灵敏度不太高，也容易受到杂质干扰。
串联四级杆液质可以做到多级的结构分析，且由于扣除背景较好，能够进行超低含量的分析。适合进行低含量的检测。
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