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本区包括海南省、台湾省及南海诸岛、福建省东南部、广东省南部、广西自治区南部及云南省西南部。本区大陆部分的地势为西北高，东南低。气温较高，湿度也大，属南亚热带及中亚热带。植被为南亚热带常绿阔叶林，热带季雨林以及赤道热带珊瑚岛植被。
全区有中药资源近4000种，其中植物类3500种，动物类200多种，矿物药30种左右。区内多道地南药，著名的有：广藿香（Pogostemon cablin）、巴戟天（Morinda officinalis）、钩藤（Uncaria rhynchophylla）、槟榔（Areca catechu）、诃子（Terminalia chebu1a）、肉桂（Cinnamomum cassia）、降香（Dalbergia odorifera）、胡椒（Piper nigrum）、荜芨（Piper cubeba）、沉香（Aquilaria sinensis）、安息香（Styrax tonkinensis）、儿茶（Acacia catechu）、广豆根（Sophora tonkinensis）、千年健（ Homalomena occulta）、鸦胆子(Brucea javanica）、狗脊（Cibotium barometz），使君子（Quisqualis indica）以及一批姜南药，如干姜（Zingiber officinale）、砂仁（Amomum villosum）、益智仁（A1pinia oxyphylla）、高良姜（Alpinia officinarum）、草果（Amomum tsaoko）、山柰（Kaempferia galanga）、草豆蔻（Alpinia katsumadai）、郁金（Curcuma aromatica）、姜黄（Curcuma longa）、莪术（C. aeruginosa，C. kwangsiensis）以及大量引种的白豆蔻（Aomum compactum， A. kravanh）等。动物药中有较重要的有蛤蚧（Gekko gecko）、金钱白花蛇（Bungarus multicinctus）及穿山甲（Manis pentadacty1a）。
本区由于具有良好的热带及亚热带的自然环境条件，可选择适宜各种不同南药的小环境，继续扩大南药的引种和栽培，例如马钱子（Strychnos nux-vomica）、檀香（Santalun album）、丁香（Eugenia caryophyllata）、胖大海（Sterculia lychnophora）、乳香(Boswellia carterii）、血竭(Dracaena cambodiana）、番泻叶（Cassia angustifolia）以及白豆蔻等。
本区丰富的岭南草药使用经验，也应注意研究及开发。