随着短链RNA分子的不断发现，新的功能也不断被阐释。Wassarman和Saecker最近向我们展示了原核6S RNA分子。该分子能有效阻断RNAP分子与启动子序列结合，阻断蛋白的表达。该研究成果发表在11月24日的《Science》杂志上。
很多调节性非编码的短链RNA通过与目标RNA链碱基配对，干涉它们的翻译和/或影响它们的稳定性。但并非所有这类RNA都以这种方式起作用。高度保守的原核6S RNA可以与大肠杆菌(Escherichia coli)中含δ70的RNA聚合酶（RNA polymerase；RNAP）相互作用并抑制该酶的活性。6S RNA包含了一段单链的RNA膨胀环结构（bulge structure），这个结构有些类似于基因的启动子上 “开放性复合体”（open complex；备注1）结构，暗示着这些RNA分子可能会与启动子竞争性结合RNAP分子。Wassarman和Saecker指出膨胀环确实类似于“开放性复合体”，结合到RNAP的活化位点上，打断了RNAP结合“合法靶点”的安排。在核苷酸存在的环境里，RNAP可以从6S RNA模板上合成短链RNA产物，该过程也促使RNAP分子的解体。体内的实验表明，细胞静息状态下，6S RNA发挥作用“解体”RNAP分子；营养充足时，6S RNA主动“释放”RNAP分子让其履行原定义务。
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