在1月18日出版的《Nature》和1月19日《Science》杂志上，有两篇文章是聚焦于细菌基因组研究，内容分别是在三种海洋黄杆菌中发现了proteorhodopsin基因，以及一种病原菌测序完成。
在第一篇文章中，来自日本的研究人员对三种海洋黄杆菌（flavobacteria）进行了全面的基因组分析，结果发现在这三种细菌中都存在proteorhodopsin基因。
Proteorhodopsin（变形菌视紫质）基因作为海水中的DNA片断是早在任何人知道它们来自什么生物之前就被发现的。它们为独立于光的质子泵编码——后者被认为通过为
微生物代谢提供能量而在海洋生态中扮演一个重要角色。在2005年研究人员发现了完整的Proteorhodopsin体系，这一体系存在于SAR11——地球上最丰富的生物之一中，这些生物具有Proteorhodopsin的质子泵，具有在黑暗中和在光线下能够生长得同样好的奇特本领（对一种聚光生物而言）。
虽然这种基因序列在非人工培植的海洋细菌的基因组中已经被发现，但是在培养中含有proteorhodopsin的细菌分离菌种的缺乏，妨碍了对这一新的光营养形式的功能研究。在这篇文章中，研究人员通过对三种海洋黄杆菌（flavobacteria）进行全面的基因组分析，发现在这三种细菌中都存在proteorhodopsin基因，生长实验显示，当这些细菌中其中一种在光下生长时，细胞产率就会增加。黄杆菌是海洋浮游细菌的一个重要组成成分，而proteorhodopsin似乎是海洋能量平衡体系中的一个重要成员。
在第二篇文章中，来自美国基因组研究所（Institute for Genomic Research），英国纽卡斯尔大学（Newcastle University），台湾长庚大学（Chang Gung University），丹麦理工大学（Technical University of Denmark），加拿大卡尔加里大学（University of Calgary），比利时根特大学（Ghent University）等多国组成的研究团队通过对阴道滴虫的
遗传图谱进行分析，发现了大量的重复基因——约占了全部基因组（160-megabase）的三分之二（65％）。
NIH院长Elias A. Zerhouni表示，“这些对生物体基因组序列的解码，比如阴道毛滴虫，将有助于加深科学家们对这些生物体的理解，这样我们才能更好的解决公共卫生事务。”NIAID院长Anthony S. Fauci也认为，“通过对阴道毛滴虫病原体遗传组成更深入的了解，我们能研制更有效的药物，治疗和预防这种疾病。”
文章的第一作者Jane M. Carlton博士则表示。“
寄生虫通常比非寄生虫类生物具有更少的DNA数量，但是对于这一病原虫，我们发现DNA数量比我们预期认为的要多十倍。”尽管对于如此庞大的重复序列科学家们没有给出完整的解释，但是研究者认为它们是长期进化的产物。从刚开始的肠中寄生到后来的泌尿生殖道中寄生，这些过程都会促使细胞体积增大，也伴随着基因组的显著变大。
除了对其序列的分析，研究人员也分析了一些可能与阴道滴虫的氢酶体相关的蛋白，这些蛋白为寄生虫提供能量，也是甲硝唑等治疗性药物的靶标分子，这将揭开寄生虫抗药的秘密。Carlton表示，“对于阴道滴虫感染机制的理解，不仅有助于开发药物治疗该病，同时也有助于我们解决与滴虫病相关的性病传播问题，包括衣原体感染(chlamydia)、淋病 (gonorrhea)等。” （生物体：万纹）
作者：
2007-1-23