美国能源部联合基因组研究所（US Department of Energy’s Joint Genome Institute 缩写，JGI）上周通知科学界，研究人员可自由获得初步的大豆基因组序列，以便利和刺激生物能源研究。
JGI的院长Eddy Rubin在1月15日圣地亚哥举行的植物和动物基因组大会上公布了这项决定。
美国能源部之所以对大豆有兴趣是因为这种作物事重要的可再生、替代燃料（生物柴油）资源。生物柴油不但在替代燃料中具有最高的能量含量，而且还比传统的石油燃料更清洁。
该机构表示，有力详细的大豆
遗传学信息，将有助于开发出更适合制造生物能源的大豆。美能源部在17号的一项声明中表示，有可能开发出一种个性化的生物质生产平台，讲生物柴油的油籽生产和先进的植物乙醇转化联合起来。
美能源部的科学家与斯坦福大学、密苏里－哥伦比亚大学、爱荷华州大学和普渡大学的研究人员一道，正在使用大规模的DNA测序来揭示大豆基因组。迄今为止，已经测序了大约1300万个片断。大豆基因组计划开始于2006年中期。（生物通雪花）
近期有关基因组研究的新闻
科学怪人基因组成为《时代》年度科学发现
素有“科学怪人”之称的著名美国科学家Craig Venter所发明的双倍体基因组序列（diploid genome sequence）登时了美国《时代》杂志的2007年度第二大最重要科学发现。另外，强生公司的一个子公司研发的一种RT-PCR
乳腺癌检测技术成为本年度第二重要的医学突破。
Craig Venter的基因组是世界首个已测序的双倍体基因组，其测序结果发表在9月的PLoS Biology杂志上。这个基因组是利用Sanger测序方法完成，他在宣布这项成果时是如此介绍：这可能是首个也是最后一个利用这种耗费成本和时间的老技术所测序的个人基因组。
Venter估计这项研究计划至少花费7000万美元。到目前为止，这种高质量的草图还没有完成。为了封闭缺口、改善单型体的装配，研究人员目前正在利用新一代的测序技术获得其他数据。
12专家：测序更多植物基因组
美国研究委员会（NRC）在本周发表的一项报告中称，以通过基因组学研究来探索植物秘密的NPGI计划应该拓展其测序能力，并且努力开发出表观基因组学和其他所谓的“omics”（生物组学，生物通注）学科的新工具。
这项由植物遗传学和其他领域的12位专家委员所准备的报告回顾了十年美国基因组学研究计划的成果，并且给出了将来研究的方向和目标。
在这些建议中，12专家呼吁扩大植物基因组测序、植物相关
微生物测序、植物相关宏基因组（metagenome）测序和相关高质量注释。（宏基因组（Metagenome）是特定环境或共生体内所有生物遗传物质的总和，是一种不依赖于人工培养的微生物基因组分析技术。宏基因组方法很大程度上依赖于提取DNA的纯度，大片段DNA的成功克隆也是宏基因组方法的关键。生物通注）
为了满足这个要求，这项报告还建议NPGI能够拓展其与DOE联合基因组研究所得现有合作关系，并且能够让研究人员接触合利用新一代测序技术进行基因组学和宏基因组研究。
该报告还鼓励开发一些仔细选择的植物种类的高精度“omics”资源以及一些传统物种的更宽或更窄水平的数据资源。
其他的建议包括使用系统方法来提高美国在重要农作物和树种方面的竞争力，集中研究植物进化，并且将所有这类研究归为植物改良计划。
作者：
2008-1-24